Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
FOXO1Q12778 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
FOXO1Q12778 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
FOXO1Q12778 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
FOXO1Q12778 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
FOXO1Q12778 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
FOXO1Q12778 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
FOXO1Q12778 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
FOXO1Q12778 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
FOXO1Q12778 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
FOXO1Q12778 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
FOXO1Q12778 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
FOXO1Q12778 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
FOXO1Q12778 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
FOXO1Q12778 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
FOXO1Q12778 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
FOXO1Q12778 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
FOXO1Q12778 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
FOXO1Q12778 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
FOXO1Q12778 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
FOXO1Q12778 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
FOXO1Q12778 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
FOXO1Q12778 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
FOXO1Q12778 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
FOXO1Q12778 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
FOXO1Q12778 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC2.07□□□□□ -2.08
FOXO1Q12778 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
FOXO1Q12778 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
FOXO1Q12778 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
FOXO1Q12778 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
FOXO1Q12778 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
FOXO1Q12778 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
FOXO1Q12778 RNU6-1011P-201ENST00000384668 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
FOXO1Q12778 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
FOXO1Q12778 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
FOXO1Q12778 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
FOXO1Q12778 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
FOXO1Q12778 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
FOXO1Q12778 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
FOXO1Q12778 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
FOXO1Q12778 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
FOXO1Q12778 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
FOXO1Q12778 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
FOXO1Q12778 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
FOXO1Q12778 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
FOXO1Q12778 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
FOXO1Q12778 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
FOXO1Q12778 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
FOXO1Q12778 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
FOXO1Q12778 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
FOXO1Q12778 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
FOXO1Q12778 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
FOXO1Q12778 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
FOXO1Q12778 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
FOXO1Q12778 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
FOXO1Q12778 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
FOXO1Q12778 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
FOXO1Q12778 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
FOXO1Q12778 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
FOXO1Q12778 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
FOXO1Q12778 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
FOXO1Q12778 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
FOXO1Q12778 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
FOXO1Q12778 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
FOXO1Q12778 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
FOXO1Q12778 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
FOXO1Q12778 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
FOXO1Q12778 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
FOXO1Q12778 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
FOXO1Q12778 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
FOXO1Q12778 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
FOXO1Q12778 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
FOXO1Q12778 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
FOXO1Q12778 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
FOXO1Q12778 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
FOXO1Q12778 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
FOXO1Q12778 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
FOXO1Q12778 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
FOXO1Q12778 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
FOXO1Q12778 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
FOXO1Q12778 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
FOXO1Q12778 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
FOXO1Q12778 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
FOXO1Q12778 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
FOXO1Q12778 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.09
FOXO1Q12778 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
FOXO1Q12778 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
FOXO1Q12778 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
FOXO1Q12778 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
FOXO1Q12778 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
FOXO1Q12778 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
FOXO1Q12778 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
FOXO1Q12778 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
FOXO1Q12778 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
FOXO1Q12778 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
FOXO1Q12778 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
FOXO1Q12778 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
FOXO1Q12778 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
FOXO1Q12778 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
FOXO1Q12778 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.1 ms