Protein–RNA interactions for Protein: Q08ER8

ZNF543, Zinc finger protein 543, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF543Q08ER8 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
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ZNF543Q08ER8 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZNF543Q08ER8 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZNF543Q08ER8 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ZNF543Q08ER8 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZNF543Q08ER8 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
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ZNF543Q08ER8 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZNF543Q08ER8 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
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ZNF543Q08ER8 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
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ZNF543Q08ER8 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
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ZNF543Q08ER8 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
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ZNF543Q08ER8 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
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ZNF543Q08ER8 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ZNF543Q08ER8 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
ZNF543Q08ER8 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
ZNF543Q08ER8 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
ZNF543Q08ER8 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
ZNF543Q08ER8 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
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