Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
EPHB4P54760 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
EPHB4P54760 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
EPHB4P54760 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
EPHB4P54760 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
EPHB4P54760 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
EPHB4P54760 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC3□□□□□ -1.93
EPHB4P54760 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC3□□□□□ -1.93
EPHB4P54760 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC3□□□□□ -1.93
EPHB4P54760 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC3□□□□□ -1.93
EPHB4P54760 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC3□□□□□ -1.93
EPHB4P54760 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC3□□□□□ -1.93
EPHB4P54760 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC3□□□□□ -1.93
EPHB4P54760 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
EPHB4P54760 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC3□□□□□ -1.93
EPHB4P54760 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC3□□□□□ -1.93
EPHB4P54760 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC3□□□□□ -1.93
EPHB4P54760 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
EPHB4P54760 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC3□□□□□ -1.93
EPHB4P54760 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
EPHB4P54760 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
EPHB4P54760 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
EPHB4P54760 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
EPHB4P54760 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
EPHB4P54760 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
EPHB4P54760 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
EPHB4P54760 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
EPHB4P54760 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
EPHB4P54760 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
EPHB4P54760 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
EPHB4P54760 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
EPHB4P54760 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
EPHB4P54760 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
EPHB4P54760 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
EPHB4P54760 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
EPHB4P54760 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
EPHB4P54760 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
EPHB4P54760 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
EPHB4P54760 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
EPHB4P54760 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
EPHB4P54760 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
EPHB4P54760 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
EPHB4P54760 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
EPHB4P54760 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
EPHB4P54760 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
EPHB4P54760 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
EPHB4P54760 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
EPHB4P54760 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
EPHB4P54760 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
EPHB4P54760 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
EPHB4P54760 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
EPHB4P54760 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
EPHB4P54760 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
EPHB4P54760 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
EPHB4P54760 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
EPHB4P54760 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
EPHB4P54760 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
EPHB4P54760 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
EPHB4P54760 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
EPHB4P54760 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
EPHB4P54760 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
EPHB4P54760 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
EPHB4P54760 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
EPHB4P54760 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
EPHB4P54760 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
EPHB4P54760 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
EPHB4P54760 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
EPHB4P54760 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
EPHB4P54760 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
EPHB4P54760 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
EPHB4P54760 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
EPHB4P54760 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
EPHB4P54760 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
EPHB4P54760 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
EPHB4P54760 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
EPHB4P54760 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
EPHB4P54760 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
EPHB4P54760 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
EPHB4P54760 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
EPHB4P54760 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC2.97□□□□□ -1.93
EPHB4P54760 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
EPHB4P54760 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
EPHB4P54760 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
EPHB4P54760 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
EPHB4P54760 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
EPHB4P54760 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
EPHB4P54760 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
EPHB4P54760 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
EPHB4P54760 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
EPHB4P54760 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
EPHB4P54760 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
EPHB4P54760 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
EPHB4P54760 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
EPHB4P54760 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
EPHB4P54760 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
EPHB4P54760 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
EPHB4P54760 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
EPHB4P54760 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
EPHB4P54760 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
EPHB4P54760 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
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