Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

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Length 548 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ERFP50548 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ERFP50548 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ERFP50548 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ERFP50548 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ERFP50548 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ERFP50548 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ERFP50548 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ERFP50548 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ERFP50548 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ERFP50548 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ERFP50548 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ERFP50548 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ERFP50548 MTATP6P17-201ENST00000431030 672 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ERFP50548 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ERFP50548 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ERFP50548 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ERFP50548 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ERFP50548 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ERFP50548 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ERFP50548 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ERFP50548 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC0.63□□□□□ -2.31
ERFP50548 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ERFP50548 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ERFP50548 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ERFP50548 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.63□□□□□ -2.31
ERFP50548 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC0.62□□□□□ -2.31
ERFP50548 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ERFP50548 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ERFP50548 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ERFP50548 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ERFP50548 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ERFP50548 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ERFP50548 AL158828.1-201ENST00000438582 197 ntTSL 5 BASIC0.62□□□□□ -2.31
ERFP50548 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
ERFP50548 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ERFP50548 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC0.62□□□□□ -2.31
ERFP50548 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
ERFP50548 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ERFP50548 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ERFP50548 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ERFP50548 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC0.62□□□□□ -2.31
ERFP50548 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ERFP50548 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ERFP50548 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ERFP50548 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ERFP50548 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC0.62□□□□□ -2.31
ERFP50548 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ERFP50548 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ERFP50548 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ERFP50548 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ERFP50548 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ERFP50548 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ERFP50548 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ERFP50548 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC0.61□□□□□ -2.31
ERFP50548 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC0.61□□□□□ -2.31
ERFP50548 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ERFP50548 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC0.61□□□□□ -2.31
ERFP50548 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ERFP50548 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC0.61□□□□□ -2.31
ERFP50548 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ERFP50548 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ERFP50548 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ERFP50548 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ERFP50548 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ERFP50548 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.6□□□□□ -2.31
ERFP50548 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ERFP50548 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ERFP50548 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ERFP50548 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ERFP50548 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ERFP50548 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ERFP50548 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ERFP50548 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ERFP50548 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC0.6□□□□□ -2.31
ERFP50548 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ERFP50548 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ERFP50548 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ERFP50548 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ERFP50548 AC026407.1-201ENST00000518369 204 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ERFP50548 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ERFP50548 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC0.6□□□□□ -2.31
ERFP50548 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC0.6□□□□□ -2.31
ERFP50548 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ERFP50548 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
ERFP50548 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
ERFP50548 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
ERFP50548 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
ERFP50548 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
ERFP50548 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
ERFP50548 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC0.59□□□□□ -2.31
ERFP50548 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
ERFP50548 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
ERFP50548 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
ERFP50548 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
ERFP50548 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
ERFP50548 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
ERFP50548 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC0.59□□□□□ -2.31
ERFP50548 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC0.59□□□□□ -2.31
ERFP50548 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC0.59□□□□□ -2.31
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