Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SOBPA7XYQ1 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SOBPA7XYQ1 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SOBPA7XYQ1 AP000553.6-201ENST00000641242 118 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SOBPA7XYQ1 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SOBPA7XYQ1 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
SOBPA7XYQ1 ABCD2-201ENST00000308666 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
SOBPA7XYQ1 GPRC6A-201ENST00000310357 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
SOBPA7XYQ1 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
SOBPA7XYQ1 ANKRD28-215ENST00000624145 6383 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SOBPA7XYQ1 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SOBPA7XYQ1 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SOBPA7XYQ1 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SOBPA7XYQ1 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SOBPA7XYQ1 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SOBPA7XYQ1 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SOBPA7XYQ1 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SOBPA7XYQ1 MCF2-210ENST00000536274 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SOBPA7XYQ1 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SOBPA7XYQ1 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SOBPA7XYQ1 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SOBPA7XYQ1 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SOBPA7XYQ1 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SOBPA7XYQ1 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SOBPA7XYQ1 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SOBPA7XYQ1 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SOBPA7XYQ1 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SOBPA7XYQ1 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SOBPA7XYQ1 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SOBPA7XYQ1 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SOBPA7XYQ1 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SOBPA7XYQ1 AP005264.4-201ENST00000592203 422 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SOBPA7XYQ1 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SOBPA7XYQ1 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
SOBPA7XYQ1 AC087521.2-201ENST00000499066 2190 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SOBPA7XYQ1 TAX1BP1-213ENST00000543117 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SOBPA7XYQ1 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
SOBPA7XYQ1 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
SOBPA7XYQ1 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
SOBPA7XYQ1 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
SOBPA7XYQ1 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SOBPA7XYQ1 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SOBPA7XYQ1 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SOBPA7XYQ1 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SOBPA7XYQ1 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SOBPA7XYQ1 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SOBPA7XYQ1 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SOBPA7XYQ1 R3HDM1-220ENST00000628915 4325 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SOBPA7XYQ1 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
SOBPA7XYQ1 OR10J1-203ENST00000642080 3503 ntAPPRIS P1 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SOBPA7XYQ1 UACA-202ENST00000379983 4859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SOBPA7XYQ1 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
SOBPA7XYQ1 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
SOBPA7XYQ1 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SOBPA7XYQ1 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SOBPA7XYQ1 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SOBPA7XYQ1 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SOBPA7XYQ1 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SOBPA7XYQ1 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SOBPA7XYQ1 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SOBPA7XYQ1 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SOBPA7XYQ1 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SOBPA7XYQ1 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SOBPA7XYQ1 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SOBPA7XYQ1 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SOBPA7XYQ1 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SOBPA7XYQ1 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SOBPA7XYQ1 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SOBPA7XYQ1 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SOBPA7XYQ1 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
SOBPA7XYQ1 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SOBPA7XYQ1 OR56A3-203ENST00000641160 4438 ntAPPRIS P1 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SOBPA7XYQ1 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SOBPA7XYQ1 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SOBPA7XYQ1 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SOBPA7XYQ1 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SOBPA7XYQ1 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SOBPA7XYQ1 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SOBPA7XYQ1 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SOBPA7XYQ1 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SOBPA7XYQ1 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SOBPA7XYQ1 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SOBPA7XYQ1 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SOBPA7XYQ1 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SOBPA7XYQ1 PCDH15-234ENST00000622048 6820 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SOBPA7XYQ1 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SOBPA7XYQ1 DENND2C-203ENST00000393277 4730 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SOBPA7XYQ1 ZBTB37-201ENST00000367701 19128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
SOBPA7XYQ1 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SOBPA7XYQ1 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
SOBPA7XYQ1 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SOBPA7XYQ1 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SOBPA7XYQ1 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SOBPA7XYQ1 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SOBPA7XYQ1 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SOBPA7XYQ1 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
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