Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII4

HERC5, E3 ISG15--protein ligase HERC5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC5Q9UII4 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HERC5Q9UII4 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
HERC5Q9UII4 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HERC5Q9UII4 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HERC5Q9UII4 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HERC5Q9UII4 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HERC5Q9UII4 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HERC5Q9UII4 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HERC5Q9UII4 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
HERC5Q9UII4 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HERC5Q9UII4 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HERC5Q9UII4 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HERC5Q9UII4 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HERC5Q9UII4 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HERC5Q9UII4 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HERC5Q9UII4 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HERC5Q9UII4 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HERC5Q9UII4 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HERC5Q9UII4 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HERC5Q9UII4 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HERC5Q9UII4 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HERC5Q9UII4 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HERC5Q9UII4 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HERC5Q9UII4 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HERC5Q9UII4 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HERC5Q9UII4 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
HERC5Q9UII4 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
HERC5Q9UII4 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HERC5Q9UII4 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HERC5Q9UII4 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HERC5Q9UII4 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
HERC5Q9UII4 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HERC5Q9UII4 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HERC5Q9UII4 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HERC5Q9UII4 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
HERC5Q9UII4 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HERC5Q9UII4 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HERC5Q9UII4 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HERC5Q9UII4 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HERC5Q9UII4 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
HERC5Q9UII4 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
HERC5Q9UII4 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HERC5Q9UII4 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HERC5Q9UII4 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HERC5Q9UII4 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HERC5Q9UII4 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HERC5Q9UII4 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HERC5Q9UII4 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HERC5Q9UII4 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HERC5Q9UII4 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HERC5Q9UII4 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC2.28□□□□□ -2.04
HERC5Q9UII4 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HERC5Q9UII4 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HERC5Q9UII4 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HERC5Q9UII4 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HERC5Q9UII4 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HERC5Q9UII4 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HERC5Q9UII4 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HERC5Q9UII4 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HERC5Q9UII4 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HERC5Q9UII4 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
HERC5Q9UII4 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HERC5Q9UII4 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HERC5Q9UII4 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HERC5Q9UII4 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
HERC5Q9UII4 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HERC5Q9UII4 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HERC5Q9UII4 snosnR66.1-201ENST00000391095 99 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HERC5Q9UII4 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HERC5Q9UII4 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HERC5Q9UII4 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HERC5Q9UII4 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HERC5Q9UII4 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
HERC5Q9UII4 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HERC5Q9UII4 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HERC5Q9UII4 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HERC5Q9UII4 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HERC5Q9UII4 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
HERC5Q9UII4 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HERC5Q9UII4 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HERC5Q9UII4 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HERC5Q9UII4 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HERC5Q9UII4 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
HERC5Q9UII4 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
HERC5Q9UII4 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
HERC5Q9UII4 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
HERC5Q9UII4 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
HERC5Q9UII4 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HERC5Q9UII4 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
HERC5Q9UII4 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HERC5Q9UII4 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HERC5Q9UII4 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HERC5Q9UII4 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
HERC5Q9UII4 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HERC5Q9UII4 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HERC5Q9UII4 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HERC5Q9UII4 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HERC5Q9UII4 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
HERC5Q9UII4 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HERC5Q9UII4 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
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