Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
COPS7AQ9UBW8 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
COPS7AQ9UBW8 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
COPS7AQ9UBW8 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
COPS7AQ9UBW8 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
COPS7AQ9UBW8 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
COPS7AQ9UBW8 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
COPS7AQ9UBW8 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
COPS7AQ9UBW8 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
COPS7AQ9UBW8 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
COPS7AQ9UBW8 MTND3P10-201ENST00000450967 341 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
COPS7AQ9UBW8 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
COPS7AQ9UBW8 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
COPS7AQ9UBW8 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
COPS7AQ9UBW8 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
COPS7AQ9UBW8 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
COPS7AQ9UBW8 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
COPS7AQ9UBW8 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
COPS7AQ9UBW8 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
COPS7AQ9UBW8 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
COPS7AQ9UBW8 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
COPS7AQ9UBW8 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
COPS7AQ9UBW8 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
COPS7AQ9UBW8 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
COPS7AQ9UBW8 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
COPS7AQ9UBW8 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
COPS7AQ9UBW8 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
COPS7AQ9UBW8 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
COPS7AQ9UBW8 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
COPS7AQ9UBW8 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
COPS7AQ9UBW8 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
COPS7AQ9UBW8 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
COPS7AQ9UBW8 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
COPS7AQ9UBW8 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
COPS7AQ9UBW8 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
COPS7AQ9UBW8 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
COPS7AQ9UBW8 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
COPS7AQ9UBW8 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
COPS7AQ9UBW8 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.21
COPS7AQ9UBW8 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
COPS7AQ9UBW8 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
COPS7AQ9UBW8 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
COPS7AQ9UBW8 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
COPS7AQ9UBW8 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
COPS7AQ9UBW8 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
COPS7AQ9UBW8 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
COPS7AQ9UBW8 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
COPS7AQ9UBW8 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
COPS7AQ9UBW8 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
COPS7AQ9UBW8 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
COPS7AQ9UBW8 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
COPS7AQ9UBW8 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
COPS7AQ9UBW8 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC1.27□□□□□ -2.21
COPS7AQ9UBW8 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
COPS7AQ9UBW8 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
COPS7AQ9UBW8 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
COPS7AQ9UBW8 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
COPS7AQ9UBW8 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
COPS7AQ9UBW8 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
COPS7AQ9UBW8 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
COPS7AQ9UBW8 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
COPS7AQ9UBW8 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
COPS7AQ9UBW8 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
COPS7AQ9UBW8 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
COPS7AQ9UBW8 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
COPS7AQ9UBW8 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
COPS7AQ9UBW8 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
COPS7AQ9UBW8 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
COPS7AQ9UBW8 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
COPS7AQ9UBW8 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.25□□□□□ -2.21
COPS7AQ9UBW8 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
COPS7AQ9UBW8 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
COPS7AQ9UBW8 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
COPS7AQ9UBW8 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
COPS7AQ9UBW8 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
COPS7AQ9UBW8 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
COPS7AQ9UBW8 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
COPS7AQ9UBW8 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
COPS7AQ9UBW8 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
COPS7AQ9UBW8 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
COPS7AQ9UBW8 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
COPS7AQ9UBW8 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
COPS7AQ9UBW8 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
COPS7AQ9UBW8 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
COPS7AQ9UBW8 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
COPS7AQ9UBW8 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
COPS7AQ9UBW8 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
COPS7AQ9UBW8 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
COPS7AQ9UBW8 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
COPS7AQ9UBW8 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 147.9 ms