Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
EHD3Q9NZN3 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
EHD3Q9NZN3 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
EHD3Q9NZN3 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
EHD3Q9NZN3 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
EHD3Q9NZN3 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
EHD3Q9NZN3 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
EHD3Q9NZN3 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
EHD3Q9NZN3 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC2.49□□□□□ -2.01
EHD3Q9NZN3 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
EHD3Q9NZN3 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
EHD3Q9NZN3 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
EHD3Q9NZN3 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
EHD3Q9NZN3 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
EHD3Q9NZN3 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
EHD3Q9NZN3 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
EHD3Q9NZN3 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
EHD3Q9NZN3 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
EHD3Q9NZN3 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
EHD3Q9NZN3 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
EHD3Q9NZN3 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
EHD3Q9NZN3 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
EHD3Q9NZN3 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
EHD3Q9NZN3 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
EHD3Q9NZN3 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
EHD3Q9NZN3 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
EHD3Q9NZN3 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
EHD3Q9NZN3 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
EHD3Q9NZN3 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
EHD3Q9NZN3 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
EHD3Q9NZN3 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
EHD3Q9NZN3 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
EHD3Q9NZN3 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
EHD3Q9NZN3 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
EHD3Q9NZN3 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
EHD3Q9NZN3 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
EHD3Q9NZN3 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
EHD3Q9NZN3 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
EHD3Q9NZN3 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
EHD3Q9NZN3 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
EHD3Q9NZN3 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
EHD3Q9NZN3 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
EHD3Q9NZN3 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.47□□□□□ -2.01
EHD3Q9NZN3 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
EHD3Q9NZN3 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
EHD3Q9NZN3 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
EHD3Q9NZN3 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
EHD3Q9NZN3 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
EHD3Q9NZN3 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
EHD3Q9NZN3 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
EHD3Q9NZN3 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
EHD3Q9NZN3 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
EHD3Q9NZN3 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
EHD3Q9NZN3 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
EHD3Q9NZN3 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
EHD3Q9NZN3 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
EHD3Q9NZN3 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
EHD3Q9NZN3 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
EHD3Q9NZN3 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
EHD3Q9NZN3 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
EHD3Q9NZN3 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
EHD3Q9NZN3 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
EHD3Q9NZN3 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
EHD3Q9NZN3 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.01
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EHD3Q9NZN3 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
EHD3Q9NZN3 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
EHD3Q9NZN3 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
EHD3Q9NZN3 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
EHD3Q9NZN3 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
EHD3Q9NZN3 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
EHD3Q9NZN3 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
EHD3Q9NZN3 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
EHD3Q9NZN3 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
EHD3Q9NZN3 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
EHD3Q9NZN3 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
EHD3Q9NZN3 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
EHD3Q9NZN3 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
EHD3Q9NZN3 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
EHD3Q9NZN3 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
EHD3Q9NZN3 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
EHD3Q9NZN3 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
EHD3Q9NZN3 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
EHD3Q9NZN3 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
EHD3Q9NZN3 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
EHD3Q9NZN3 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
EHD3Q9NZN3 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
EHD3Q9NZN3 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
EHD3Q9NZN3 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
EHD3Q9NZN3 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
EHD3Q9NZN3 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
EHD3Q9NZN3 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
EHD3Q9NZN3 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
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