Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC1.17□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.17□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC1.17□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC1.17□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC1.14□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC1.14□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.14□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
LHX9Q9NQ69 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
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