Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ0

KRTAP9-8, Keratin-associated protein 9-8, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-8Q9BYQ0 ADAM29-201ENST00000359240 3325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 KCNJ16-211ENST00000615244 4190 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 CTNND1-214ENST00000526772 4966 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 ESRRG-206ENST00000366938 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 NF1-202ENST00000358273 12425 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 DNAH17-201ENST00000389840 13723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 PHC3-214ENST00000494943 5030 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 DMD-228ENST00000541735 7080 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 SSH1-202ENST00000326495 13040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL592182.3-201ENST00000642132 3304 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 SV2B-202ENST00000394232 11279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC107027.3-201ENST00000565095 3473 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 MYO5A-209ENST00000553916 5989 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 PDE1A-205ENST00000435564 4885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNY4P19-201ENST00000362530 96 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 RPS26P47-201ENST00000427219 348 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL592156.1-201ENST00000508758 304 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNA5SP73-201ENST00000516744 108 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC005086.4-201ENST00000623065 213 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 MARCH6-201ENST00000274140 9569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 FOCAD-201ENST00000338382 5765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 DHX9P1-201ENST00000436565 3076 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 MEI4-201ENST00000602452 4800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 MPHOSPH9-220ENST00000606320 6351 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF845-201ENST00000458035 4311 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL022323.4-201ENST00000623980 13120 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 RGSL1-201ENST00000294854 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 FMN1-212ENST00000616417 13529 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 DMD-211ENST00000378707 7410 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 WDR5B-201ENST00000330689 3720 ntAPPRIS P1 BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNU6-627P-201ENST00000364032 102 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 Y_RNA.260-201ENST00000364628 101 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNA5SP151-201ENST00000365632 117 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 ENOX2-202ENST00000370927 3788 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNA5SP372-201ENST00000390836 115 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 LINC00894-201ENST00000413076 403 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNA5SP497-201ENST00000516081 97 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 YES1-203ENST00000577961 4554 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC244196.2-201ENST00000621184 411 ntAPPRIS P1 BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC074140.1-201ENST00000621617 208 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 MAPK10-372ENST00000641954 3413 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 NAV1-201ENST00000367295 11645 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 TBC1D5-201ENST00000253692 7854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 PAX8-AS1-202ENST00000422956 11799 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 ANLN-202ENST00000396068 4661 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.3 ms