Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TRAPPC9Q96Q05 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TRAPPC9Q96Q05 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TRAPPC9Q96Q05 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TRAPPC9Q96Q05 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TRAPPC9Q96Q05 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TRAPPC9Q96Q05 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TRAPPC9Q96Q05 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TRAPPC9Q96Q05 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
TRAPPC9Q96Q05 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
TRAPPC9Q96Q05 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
TRAPPC9Q96Q05 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TRAPPC9Q96Q05 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TRAPPC9Q96Q05 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TRAPPC9Q96Q05 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TRAPPC9Q96Q05 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TRAPPC9Q96Q05 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
TRAPPC9Q96Q05 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TRAPPC9Q96Q05 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
TRAPPC9Q96Q05 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TRAPPC9Q96Q05 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TRAPPC9Q96Q05 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
TRAPPC9Q96Q05 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TRAPPC9Q96Q05 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
TRAPPC9Q96Q05 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TRAPPC9Q96Q05 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TRAPPC9Q96Q05 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TRAPPC9Q96Q05 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TRAPPC9Q96Q05 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
TRAPPC9Q96Q05 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TRAPPC9Q96Q05 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TRAPPC9Q96Q05 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TRAPPC9Q96Q05 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC2.16□□□□□ -2.06
TRAPPC9Q96Q05 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TRAPPC9Q96Q05 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TRAPPC9Q96Q05 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TRAPPC9Q96Q05 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
TRAPPC9Q96Q05 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TRAPPC9Q96Q05 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TRAPPC9Q96Q05 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TRAPPC9Q96Q05 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TRAPPC9Q96Q05 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TRAPPC9Q96Q05 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TRAPPC9Q96Q05 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TRAPPC9Q96Q05 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TRAPPC9Q96Q05 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
TRAPPC9Q96Q05 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TRAPPC9Q96Q05 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TRAPPC9Q96Q05 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
TRAPPC9Q96Q05 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TRAPPC9Q96Q05 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TRAPPC9Q96Q05 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TRAPPC9Q96Q05 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TRAPPC9Q96Q05 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TRAPPC9Q96Q05 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TRAPPC9Q96Q05 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
TRAPPC9Q96Q05 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
TRAPPC9Q96Q05 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TRAPPC9Q96Q05 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TRAPPC9Q96Q05 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TRAPPC9Q96Q05 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TRAPPC9Q96Q05 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TRAPPC9Q96Q05 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TRAPPC9Q96Q05 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TRAPPC9Q96Q05 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TRAPPC9Q96Q05 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TRAPPC9Q96Q05 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TRAPPC9Q96Q05 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
TRAPPC9Q96Q05 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TRAPPC9Q96Q05 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TRAPPC9Q96Q05 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TRAPPC9Q96Q05 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TRAPPC9Q96Q05 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
TRAPPC9Q96Q05 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TRAPPC9Q96Q05 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
TRAPPC9Q96Q05 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TRAPPC9Q96Q05 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.9 ms