Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
UBXN4Q92575 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
UBXN4Q92575 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
UBXN4Q92575 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
UBXN4Q92575 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
UBXN4Q92575 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
UBXN4Q92575 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
UBXN4Q92575 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
UBXN4Q92575 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
UBXN4Q92575 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
UBXN4Q92575 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
UBXN4Q92575 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
UBXN4Q92575 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
UBXN4Q92575 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
UBXN4Q92575 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
UBXN4Q92575 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
UBXN4Q92575 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
UBXN4Q92575 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
UBXN4Q92575 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
UBXN4Q92575 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
UBXN4Q92575 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
UBXN4Q92575 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
UBXN4Q92575 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
UBXN4Q92575 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
UBXN4Q92575 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
UBXN4Q92575 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
UBXN4Q92575 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
UBXN4Q92575 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
UBXN4Q92575 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
UBXN4Q92575 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
UBXN4Q92575 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
UBXN4Q92575 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
UBXN4Q92575 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
UBXN4Q92575 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
UBXN4Q92575 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
UBXN4Q92575 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
UBXN4Q92575 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
UBXN4Q92575 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
UBXN4Q92575 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
UBXN4Q92575 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
UBXN4Q92575 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
UBXN4Q92575 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
UBXN4Q92575 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
UBXN4Q92575 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
UBXN4Q92575 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
UBXN4Q92575 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
UBXN4Q92575 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
UBXN4Q92575 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
UBXN4Q92575 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
UBXN4Q92575 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
UBXN4Q92575 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
UBXN4Q92575 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
UBXN4Q92575 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
UBXN4Q92575 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
UBXN4Q92575 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
UBXN4Q92575 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
UBXN4Q92575 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
UBXN4Q92575 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
UBXN4Q92575 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
UBXN4Q92575 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
UBXN4Q92575 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
UBXN4Q92575 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
UBXN4Q92575 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
UBXN4Q92575 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
UBXN4Q92575 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
UBXN4Q92575 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
UBXN4Q92575 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
UBXN4Q92575 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
UBXN4Q92575 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
UBXN4Q92575 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
UBXN4Q92575 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
UBXN4Q92575 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
UBXN4Q92575 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
UBXN4Q92575 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
UBXN4Q92575 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
UBXN4Q92575 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
UBXN4Q92575 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
UBXN4Q92575 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
UBXN4Q92575 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
UBXN4Q92575 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
UBXN4Q92575 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
UBXN4Q92575 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
UBXN4Q92575 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
UBXN4Q92575 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
UBXN4Q92575 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
UBXN4Q92575 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
UBXN4Q92575 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
UBXN4Q92575 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
UBXN4Q92575 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
UBXN4Q92575 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
UBXN4Q92575 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
UBXN4Q92575 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
UBXN4Q92575 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
UBXN4Q92575 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
UBXN4Q92575 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
UBXN4Q92575 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
UBXN4Q92575 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
UBXN4Q92575 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
UBXN4Q92575 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
UBXN4Q92575 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
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