Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ3

USP30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP30Q70CQ3 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USP30Q70CQ3 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USP30Q70CQ3 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USP30Q70CQ3 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USP30Q70CQ3 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USP30Q70CQ3 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USP30Q70CQ3 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USP30Q70CQ3 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
USP30Q70CQ3 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USP30Q70CQ3 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USP30Q70CQ3 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USP30Q70CQ3 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
USP30Q70CQ3 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
USP30Q70CQ3 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
USP30Q70CQ3 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
USP30Q70CQ3 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
USP30Q70CQ3 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
USP30Q70CQ3 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
USP30Q70CQ3 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
USP30Q70CQ3 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
USP30Q70CQ3 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
USP30Q70CQ3 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
USP30Q70CQ3 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
USP30Q70CQ3 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
USP30Q70CQ3 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
USP30Q70CQ3 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
USP30Q70CQ3 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
USP30Q70CQ3 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
USP30Q70CQ3 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
USP30Q70CQ3 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
USP30Q70CQ3 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
USP30Q70CQ3 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
USP30Q70CQ3 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
USP30Q70CQ3 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
USP30Q70CQ3 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
USP30Q70CQ3 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
USP30Q70CQ3 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
USP30Q70CQ3 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
USP30Q70CQ3 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
USP30Q70CQ3 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
USP30Q70CQ3 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
USP30Q70CQ3 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
USP30Q70CQ3 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
USP30Q70CQ3 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
USP30Q70CQ3 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
USP30Q70CQ3 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
USP30Q70CQ3 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
USP30Q70CQ3 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
USP30Q70CQ3 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
USP30Q70CQ3 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
USP30Q70CQ3 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
USP30Q70CQ3 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
USP30Q70CQ3 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
USP30Q70CQ3 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
USP30Q70CQ3 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
USP30Q70CQ3 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
USP30Q70CQ3 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
USP30Q70CQ3 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
USP30Q70CQ3 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
USP30Q70CQ3 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
USP30Q70CQ3 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
USP30Q70CQ3 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
USP30Q70CQ3 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
USP30Q70CQ3 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
USP30Q70CQ3 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
USP30Q70CQ3 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
USP30Q70CQ3 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
USP30Q70CQ3 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
USP30Q70CQ3 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
USP30Q70CQ3 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
USP30Q70CQ3 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
USP30Q70CQ3 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
USP30Q70CQ3 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
USP30Q70CQ3 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
USP30Q70CQ3 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
USP30Q70CQ3 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
USP30Q70CQ3 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
USP30Q70CQ3 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
USP30Q70CQ3 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
USP30Q70CQ3 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
USP30Q70CQ3 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
USP30Q70CQ3 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
USP30Q70CQ3 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
USP30Q70CQ3 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
USP30Q70CQ3 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
USP30Q70CQ3 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
USP30Q70CQ3 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
USP30Q70CQ3 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
USP30Q70CQ3 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
USP30Q70CQ3 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
USP30Q70CQ3 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
USP30Q70CQ3 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
USP30Q70CQ3 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
USP30Q70CQ3 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
USP30Q70CQ3 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
USP30Q70CQ3 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
USP30Q70CQ3 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
USP30Q70CQ3 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
USP30Q70CQ3 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
USP30Q70CQ3 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98 ms