Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC0.78□□□□□ -2.28
SP6Q3SY56 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SP6Q3SY56 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SP6Q3SY56 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SP6Q3SY56 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SP6Q3SY56 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SP6Q3SY56 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SP6Q3SY56 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SP6Q3SY56 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SP6Q3SY56 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SP6Q3SY56 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SP6Q3SY56 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SP6Q3SY56 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SP6Q3SY56 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
SP6Q3SY56 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
SP6Q3SY56 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
SP6Q3SY56 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SP6Q3SY56 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SP6Q3SY56 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SP6Q3SY56 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SP6Q3SY56 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SP6Q3SY56 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SP6Q3SY56 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SP6Q3SY56 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC0.77□□□□□ -2.29
SP6Q3SY56 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.76□□□□□ -2.29
SP6Q3SY56 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SP6Q3SY56 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SP6Q3SY56 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SP6Q3SY56 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SP6Q3SY56 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SP6Q3SY56 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.76□□□□□ -2.29
SP6Q3SY56 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SP6Q3SY56 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SP6Q3SY56 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC0.76□□□□□ -2.29
SP6Q3SY56 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SP6Q3SY56 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SP6Q3SY56 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SP6Q3SY56 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC0.76□□□□□ -2.29
SP6Q3SY56 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SP6Q3SY56 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SP6Q3SY56 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC0.76□□□□□ -2.29
SP6Q3SY56 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SP6Q3SY56 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SP6Q3SY56 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SP6Q3SY56 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SP6Q3SY56 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SP6Q3SY56 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC0.76□□□□□ -2.29
SP6Q3SY56 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SP6Q3SY56 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SP6Q3SY56 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SP6Q3SY56 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SP6Q3SY56 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SP6Q3SY56 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SP6Q3SY56 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SP6Q3SY56 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SP6Q3SY56 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SP6Q3SY56 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SP6Q3SY56 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SP6Q3SY56 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SP6Q3SY56 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SP6Q3SY56 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SP6Q3SY56 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SP6Q3SY56 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SP6Q3SY56 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC0.75□□□□□ -2.29
SP6Q3SY56 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SP6Q3SY56 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SP6Q3SY56 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SP6Q3SY56 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SP6Q3SY56 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SP6Q3SY56 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC0.75□□□□□ -2.29
SP6Q3SY56 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SP6Q3SY56 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SP6Q3SY56 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SP6Q3SY56 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SP6Q3SY56 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SP6Q3SY56 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SP6Q3SY56 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SP6Q3SY56 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SP6Q3SY56 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SP6Q3SY56 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SP6Q3SY56 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SP6Q3SY56 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SP6Q3SY56 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC0.74□□□□□ -2.29
SP6Q3SY56 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SP6Q3SY56 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SP6Q3SY56 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SP6Q3SY56 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SP6Q3SY56 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SP6Q3SY56 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
SP6Q3SY56 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SP6Q3SY56 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SP6Q3SY56 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SP6Q3SY56 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SP6Q3SY56 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
SP6Q3SY56 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SP6Q3SY56 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.73□□□□□ -2.29
SP6Q3SY56 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SP6Q3SY56 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SP6Q3SY56 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SP6Q3SY56 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.8 ms