Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
ME3Q16798 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ME3Q16798 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ME3Q16798 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ME3Q16798 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ME3Q16798 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ME3Q16798 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ME3Q16798 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ME3Q16798 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ME3Q16798 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ME3Q16798 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ME3Q16798 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ME3Q16798 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ME3Q16798 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ME3Q16798 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
ME3Q16798 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ME3Q16798 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ME3Q16798 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ME3Q16798 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ME3Q16798 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ME3Q16798 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ME3Q16798 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ME3Q16798 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ME3Q16798 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
ME3Q16798 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ME3Q16798 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ME3Q16798 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ME3Q16798 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ME3Q16798 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ME3Q16798 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ME3Q16798 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ME3Q16798 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ME3Q16798 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ME3Q16798 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ME3Q16798 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ME3Q16798 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ME3Q16798 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ME3Q16798 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ME3Q16798 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ME3Q16798 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ME3Q16798 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
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ME3Q16798 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ME3Q16798 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ME3Q16798 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ME3Q16798 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ME3Q16798 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ME3Q16798 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ME3Q16798 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ME3Q16798 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ME3Q16798 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ME3Q16798 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ME3Q16798 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ME3Q16798 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ME3Q16798 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ME3Q16798 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ME3Q16798 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ME3Q16798 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
ME3Q16798 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
ME3Q16798 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ME3Q16798 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
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ME3Q16798 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC2.11□□□□□ -2.07
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ME3Q16798 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ME3Q16798 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
ME3Q16798 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ME3Q16798 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ME3Q16798 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ME3Q16798 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
ME3Q16798 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
ME3Q16798 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ME3Q16798 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ME3Q16798 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ME3Q16798 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
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ME3Q16798 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
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ME3Q16798 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
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ME3Q16798 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ME3Q16798 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ME3Q16798 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ME3Q16798 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
ME3Q16798 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
ME3Q16798 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
ME3Q16798 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
ME3Q16798 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ME3Q16798 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ME3Q16798 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ME3Q16798 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ME3Q16798 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ME3Q16798 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
ME3Q16798 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ME3Q16798 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ME3Q16798 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
ME3Q16798 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ME3Q16798 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
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