Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 AP000484.1-201ENST00000620067 1252 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC-0.86□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 CR2-207ENST00000640301 151 ntTSL 1 (best) BASIC-0.86□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 UBE2D3P3-201ENST00000426992 425 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC-0.86□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 MTATP6P26-201ENST00000445926 662 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 AC073359.2-201ENST00000478814 351 ntTSL 3 BASIC-0.86□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC-0.86□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC-0.87□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 AC005695.2-201ENST00000579641 259 ntTSL 3 BASIC-0.87□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC-0.87□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 AC010975.3-201ENST00000618727 978 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 AC253576.2-201ENST00000618815 580 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC-0.87□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 ZNF971P-201ENST00000562068 1249 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 AC079610.2-201ENST00000604818 690 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 U6.48-201ENST00000618523 106 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC-0.87□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC-0.87□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 LINC01078-201ENST00000434832 387 ntTSL 5 BASIC-0.87□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 AC036101.1-201ENST00000449272 597 ntTSL 3 BASIC-0.87□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC-0.87□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC-0.87□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC-0.87□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 AL133368.2-201ENST00000556978 386 ntTSL 3 BASIC-0.87□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 AC021851.1-201ENST00000608537 1082 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC-0.87□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 AP002371.2-201ENST00000624450 503 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
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LAMA3Q16787 RNU6-900P-201ENST00000384498 102 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 Y_RNA.564-201ENST00000384708 106 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 FO393419.3-201ENST00000428741 282 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 AL356022.1-202ENST00000555433 379 ntTSL 2 BASIC-0.88□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC-0.88□□□□□ -2.55
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LAMA3Q16787 AC022022.2-201ENST00000602989 360 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 AL121904.1-201ENST00000611894 948 ntTSL 5 BASIC-0.88□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC-0.88□□□□□ -2.55
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LAMA3Q16787 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
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LAMA3Q16787 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
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LAMA3Q16787 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC-0.89□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 AC106883.1-201ENST00000418805 562 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC-0.89□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 LRRC6P1-201ENST00000532188 885 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 POLR2KP1-201ENST00000553226 168 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 RNU6-1128P-201ENST00000362825 109 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 RNU5E-10P-201ENST00000363506 118 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 RNU6-194P-201ENST00000363862 105 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 GYG2-AS1-201ENST00000445107 515 ntTSL 5 BASIC-0.89□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC-0.89□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC-0.89□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 AC079395.1-201ENST00000510981 262 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 AC087683.2-201ENST00000611384 326 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 AL118556.2-201ENST00000614375 824 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 AC099654.8-201ENST00000637757 681 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
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