Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
RPE65Q16518 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
RPE65Q16518 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RPE65Q16518 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RPE65Q16518 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RPE65Q16518 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RPE65Q16518 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RPE65Q16518 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RPE65Q16518 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RPE65Q16518 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
RPE65Q16518 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
RPE65Q16518 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RPE65Q16518 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RPE65Q16518 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RPE65Q16518 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RPE65Q16518 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
RPE65Q16518 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
RPE65Q16518 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RPE65Q16518 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RPE65Q16518 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RPE65Q16518 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RPE65Q16518 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
RPE65Q16518 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
RPE65Q16518 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
RPE65Q16518 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
RPE65Q16518 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
RPE65Q16518 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
RPE65Q16518 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
RPE65Q16518 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
RPE65Q16518 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
RPE65Q16518 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
RPE65Q16518 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
RPE65Q16518 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
RPE65Q16518 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
RPE65Q16518 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
RPE65Q16518 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
RPE65Q16518 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
RPE65Q16518 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
RPE65Q16518 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
RPE65Q16518 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
RPE65Q16518 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
RPE65Q16518 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
RPE65Q16518 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
RPE65Q16518 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
RPE65Q16518 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
RPE65Q16518 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
RPE65Q16518 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
RPE65Q16518 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
RPE65Q16518 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RPE65Q16518 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RPE65Q16518 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RPE65Q16518 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RPE65Q16518 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RPE65Q16518 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RPE65Q16518 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RPE65Q16518 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RPE65Q16518 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
RPE65Q16518 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RPE65Q16518 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RPE65Q16518 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RPE65Q16518 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RPE65Q16518 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RPE65Q16518 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
RPE65Q16518 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RPE65Q16518 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RPE65Q16518 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
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RPE65Q16518 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RPE65Q16518 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RPE65Q16518 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RPE65Q16518 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RPE65Q16518 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RPE65Q16518 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RPE65Q16518 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RPE65Q16518 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RPE65Q16518 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RPE65Q16518 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
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