Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC0.56□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC0.56□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 AP000770.2-201ENST00000623694 100 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 MIR3974-201ENST00000637126 96 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.55□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC0.55□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC0.55□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC0.54□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 MTCO2P7-201ENST00000446518 666 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 AL049869.2-201ENST00000556634 365 ntTSL 2 BASIC0.54□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC0.53□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC0.53□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC0.53□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC0.52□□□□□ -2.33
TNXAQ16473 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TNXAQ16473 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TNXAQ16473 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TNXAQ16473 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TNXAQ16473 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TNXAQ16473 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TNXAQ16473 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TNXAQ16473 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TNXAQ16473 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TNXAQ16473 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
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