Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NTRK3Q16288 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
NTRK3Q16288 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NTRK3Q16288 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
NTRK3Q16288 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
NTRK3Q16288 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
NTRK3Q16288 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.93
NTRK3Q16288 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
NTRK3Q16288 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NTRK3Q16288 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NTRK3Q16288 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NTRK3Q16288 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NTRK3Q16288 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NTRK3Q16288 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NTRK3Q16288 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NTRK3Q16288 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NTRK3Q16288 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NTRK3Q16288 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
NTRK3Q16288 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NTRK3Q16288 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
NTRK3Q16288 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NTRK3Q16288 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NTRK3Q16288 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
NTRK3Q16288 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NTRK3Q16288 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
NTRK3Q16288 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
NTRK3Q16288 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NTRK3Q16288 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NTRK3Q16288 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NTRK3Q16288 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
NTRK3Q16288 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
NTRK3Q16288 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
NTRK3Q16288 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
NTRK3Q16288 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NTRK3Q16288 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NTRK3Q16288 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NTRK3Q16288 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NTRK3Q16288 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
NTRK3Q16288 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NTRK3Q16288 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NTRK3Q16288 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NTRK3Q16288 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NTRK3Q16288 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
NTRK3Q16288 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
NTRK3Q16288 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NTRK3Q16288 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NTRK3Q16288 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
NTRK3Q16288 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
NTRK3Q16288 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
NTRK3Q16288 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NTRK3Q16288 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NTRK3Q16288 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NTRK3Q16288 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NTRK3Q16288 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NTRK3Q16288 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NTRK3Q16288 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NTRK3Q16288 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NTRK3Q16288 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NTRK3Q16288 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NTRK3Q16288 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NTRK3Q16288 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NTRK3Q16288 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
NTRK3Q16288 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NTRK3Q16288 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NTRK3Q16288 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NTRK3Q16288 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NTRK3Q16288 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
NTRK3Q16288 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NTRK3Q16288 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NTRK3Q16288 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
NTRK3Q16288 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NTRK3Q16288 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
NTRK3Q16288 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
NTRK3Q16288 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
NTRK3Q16288 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
NTRK3Q16288 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
NTRK3Q16288 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NTRK3Q16288 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NTRK3Q16288 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NTRK3Q16288 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NTRK3Q16288 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NTRK3Q16288 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NTRK3Q16288 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NTRK3Q16288 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NTRK3Q16288 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NTRK3Q16288 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NTRK3Q16288 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NTRK3Q16288 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NTRK3Q16288 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NTRK3Q16288 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
NTRK3Q16288 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.92□□□□□ -1.94
NTRK3Q16288 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NTRK3Q16288 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
NTRK3Q16288 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NTRK3Q16288 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NTRK3Q16288 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
NTRK3Q16288 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NTRK3Q16288 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NTRK3Q16288 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NTRK3Q16288 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.7 ms