Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SNCBQ16143 RNU6-636P-201ENST00000384598 107 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SNCBQ16143 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SNCBQ16143 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
SNCBQ16143 AC003659.1-201ENST00000424251 465 ntTSL 5 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
SNCBQ16143 AL365184.2-201ENST00000431139 435 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SNCBQ16143 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SNCBQ16143 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SNCBQ16143 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SNCBQ16143 CCDC39-AS1-201ENST00000495357 283 ntTSL 3 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
SNCBQ16143 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SNCBQ16143 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SNCBQ16143 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SNCBQ16143 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
SNCBQ16143 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SNCBQ16143 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SNCBQ16143 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
SNCBQ16143 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SNCBQ16143 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SNCBQ16143 RNU6-83P-201ENST00000384568 112 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SNCBQ16143 RNU6-127P-201ENST00000390897 107 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SNCBQ16143 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
SNCBQ16143 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
SNCBQ16143 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SNCBQ16143 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SNCBQ16143 LYRM7-202ENST00000507584 317 ntTSL 2 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
SNCBQ16143 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SNCBQ16143 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SNCBQ16143 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SNCBQ16143 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SNCBQ16143 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SNCBQ16143 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SNCBQ16143 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SNCBQ16143 AC069431.2-201ENST00000604149 1099 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SNCBQ16143 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SNCBQ16143 AC245297.3-203ENST00000612135 405 ntTSL 5 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
SNCBQ16143 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SNCBQ16143 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SNCBQ16143 RNU6-929P-201ENST00000384429 107 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SNCBQ16143 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SNCBQ16143 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
SNCBQ16143 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SNCBQ16143 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SNCBQ16143 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SNCBQ16143 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SNCBQ16143 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SNCBQ16143 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SNCBQ16143 AP000811.1-201ENST00000603803 651 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SNCBQ16143 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SNCBQ16143 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SNCBQ16143 AL049777.1-201ENST00000622740 518 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SNCBQ16143 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
SNCBQ16143 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC-0.32□□□□□ -2.46
SNCBQ16143 MTND4P9-201ENST00000507819 1346 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SNCBQ16143 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SNCBQ16143 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SNCBQ16143 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SNCBQ16143 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SNCBQ16143 RNU6-1200P-201ENST00000384162 107 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SNCBQ16143 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
SNCBQ16143 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SNCBQ16143 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SNCBQ16143 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SNCBQ16143 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SNCBQ16143 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SNCBQ16143 AC084290.1-201ENST00000434995 374 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SNCBQ16143 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
SNCBQ16143 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SNCBQ16143 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SNCBQ16143 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SNCBQ16143 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SNCBQ16143 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
SNCBQ16143 AC068137.4-201ENST00000638485 296 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SNCBQ16143 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
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SNCBQ16143 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SNCBQ16143 MIR593-201ENST00000384856 100 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SNCBQ16143 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SNCBQ16143 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SNCBQ16143 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SNCBQ16143 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
SNCBQ16143 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SNCBQ16143 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SNCBQ16143 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SNCBQ16143 MTND2P38-201ENST00000522536 667 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SNCBQ16143 AP003168.1-201ENST00000530091 307 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SNCBQ16143 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SNCBQ16143 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
SNCBQ16143 AC018554.1-201ENST00000565506 800 ntTSL 2 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
SNCBQ16143 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SNCBQ16143 ST7-OT4_4.1-201ENST00000614993 213 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SNCBQ16143 AC006927.3-201ENST00000638789 384 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SNCBQ16143 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SNCBQ16143 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SNCBQ16143 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SNCBQ16143 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SNCBQ16143 AL049545.1-201ENST00000401856 572 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SNCBQ16143 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SNCBQ16143 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SNCBQ16143 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
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