Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIK4Q16099 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIK4Q16099 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIK4Q16099 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIK4Q16099 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIK4Q16099 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIK4Q16099 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIK4Q16099 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIK4Q16099 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIK4Q16099 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIK4Q16099 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIK4Q16099 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIK4Q16099 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIK4Q16099 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIK4Q16099 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIK4Q16099 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIK4Q16099 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIK4Q16099 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIK4Q16099 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIK4Q16099 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIK4Q16099 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
GRIK4Q16099 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
GRIK4Q16099 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
GRIK4Q16099 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
GRIK4Q16099 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
GRIK4Q16099 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GRIK4Q16099 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GRIK4Q16099 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
GRIK4Q16099 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GRIK4Q16099 VDAC1P3-201ENST00000434069 851 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GRIK4Q16099 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
GRIK4Q16099 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GRIK4Q16099 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GRIK4Q16099 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GRIK4Q16099 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GRIK4Q16099 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GRIK4Q16099 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GRIK4Q16099 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GRIK4Q16099 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GRIK4Q16099 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GRIK4Q16099 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GRIK4Q16099 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GRIK4Q16099 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
GRIK4Q16099 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
GRIK4Q16099 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
GRIK4Q16099 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GRIK4Q16099 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
GRIK4Q16099 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GRIK4Q16099 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GRIK4Q16099 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GRIK4Q16099 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GRIK4Q16099 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
GRIK4Q16099 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
GRIK4Q16099 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GRIK4Q16099 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GRIK4Q16099 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GRIK4Q16099 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GRIK4Q16099 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GRIK4Q16099 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
GRIK4Q16099 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
GRIK4Q16099 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
GRIK4Q16099 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
GRIK4Q16099 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
GRIK4Q16099 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
GRIK4Q16099 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
GRIK4Q16099 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
GRIK4Q16099 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
GRIK4Q16099 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
GRIK4Q16099 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
GRIK4Q16099 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
GRIK4Q16099 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
GRIK4Q16099 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
GRIK4Q16099 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
GRIK4Q16099 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
GRIK4Q16099 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
GRIK4Q16099 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
GRIK4Q16099 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
GRIK4Q16099 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
GRIK4Q16099 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
GRIK4Q16099 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GRIK4Q16099 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
GRIK4Q16099 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GRIK4Q16099 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GRIK4Q16099 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GRIK4Q16099 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
GRIK4Q16099 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GRIK4Q16099 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GRIK4Q16099 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
GRIK4Q16099 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GRIK4Q16099 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
GRIK4Q16099 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GRIK4Q16099 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GRIK4Q16099 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GRIK4Q16099 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GRIK4Q16099 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GRIK4Q16099 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
GRIK4Q16099 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GRIK4Q16099 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GRIK4Q16099 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
GRIK4Q16099 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.4 ms