Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
ATP6AP1Q15904 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
ATP6AP1Q15904 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ATP6AP1Q15904 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ATP6AP1Q15904 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
ATP6AP1Q15904 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
ATP6AP1Q15904 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
ATP6AP1Q15904 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ATP6AP1Q15904 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ATP6AP1Q15904 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ATP6AP1Q15904 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ATP6AP1Q15904 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ATP6AP1Q15904 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ATP6AP1Q15904 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ATP6AP1Q15904 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ATP6AP1Q15904 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ATP6AP1Q15904 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ATP6AP1Q15904 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ATP6AP1Q15904 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
ATP6AP1Q15904 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ATP6AP1Q15904 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ATP6AP1Q15904 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ATP6AP1Q15904 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ATP6AP1Q15904 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ATP6AP1Q15904 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ATP6AP1Q15904 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ATP6AP1Q15904 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ATP6AP1Q15904 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ATP6AP1Q15904 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ATP6AP1Q15904 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ATP6AP1Q15904 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ATP6AP1Q15904 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ATP6AP1Q15904 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ATP6AP1Q15904 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ATP6AP1Q15904 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ATP6AP1Q15904 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ATP6AP1Q15904 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ATP6AP1Q15904 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
ATP6AP1Q15904 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ATP6AP1Q15904 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ATP6AP1Q15904 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ATP6AP1Q15904 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ATP6AP1Q15904 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ATP6AP1Q15904 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
ATP6AP1Q15904 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ATP6AP1Q15904 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ATP6AP1Q15904 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ATP6AP1Q15904 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ATP6AP1Q15904 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ATP6AP1Q15904 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ATP6AP1Q15904 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ATP6AP1Q15904 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ATP6AP1Q15904 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
ATP6AP1Q15904 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
ATP6AP1Q15904 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ATP6AP1Q15904 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC1.05□□□□□ -2.24
ATP6AP1Q15904 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ATP6AP1Q15904 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ATP6AP1Q15904 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
ATP6AP1Q15904 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
ATP6AP1Q15904 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
ATP6AP1Q15904 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ATP6AP1Q15904 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ATP6AP1Q15904 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ATP6AP1Q15904 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ATP6AP1Q15904 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ATP6AP1Q15904 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ATP6AP1Q15904 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
ATP6AP1Q15904 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ATP6AP1Q15904 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
ATP6AP1Q15904 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ATP6AP1Q15904 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ATP6AP1Q15904 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ATP6AP1Q15904 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ATP6AP1Q15904 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
ATP6AP1Q15904 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ATP6AP1Q15904 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.03□□□□□ -2.24
ATP6AP1Q15904 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
ATP6AP1Q15904 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ATP6AP1Q15904 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ATP6AP1Q15904 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ATP6AP1Q15904 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
ATP6AP1Q15904 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ATP6AP1Q15904 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
ATP6AP1Q15904 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ATP6AP1Q15904 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC1.03□□□□□ -2.24
ATP6AP1Q15904 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ATP6AP1Q15904 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ATP6AP1Q15904 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ATP6AP1Q15904 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.4 ms