Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
NEDD8Q15843 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
NEDD8Q15843 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
NEDD8Q15843 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC-0.34□□□□□ -2.46
NEDD8Q15843 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
NEDD8Q15843 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
NEDD8Q15843 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
NEDD8Q15843 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
NEDD8Q15843 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
NEDD8Q15843 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
NEDD8Q15843 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
NEDD8Q15843 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
NEDD8Q15843 MTND1P8-201ENST00000571424 950 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
NEDD8Q15843 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
NEDD8Q15843 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
NEDD8Q15843 AC010620.1-201ENST00000601088 1102 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
NEDD8Q15843 AC023932.2-201ENST00000603176 175 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
NEDD8Q15843 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
NEDD8Q15843 ST7-OT4_4.1-201ENST00000614993 213 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
NEDD8Q15843 AL049777.1-201ENST00000622740 518 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
NEDD8Q15843 MIR1295B-201ENST00000636144 60 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
NEDD8Q15843 AC006927.3-201ENST00000638789 384 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
NEDD8Q15843 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC-0.35□□□□□ -2.47
NEDD8Q15843 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
NEDD8Q15843 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
NEDD8Q15843 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
NEDD8Q15843 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
NEDD8Q15843 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
NEDD8Q15843 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
NEDD8Q15843 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC-0.35□□□□□ -2.47
NEDD8Q15843 RNU6-127P-201ENST00000390897 107 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
NEDD8Q15843 AL049545.1-201ENST00000401856 572 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
NEDD8Q15843 SSR1P2-201ENST00000415208 787 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
NEDD8Q15843 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC-0.35□□□□□ -2.47
NEDD8Q15843 AC084290.1-201ENST00000434995 374 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
NEDD8Q15843 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
NEDD8Q15843 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
NEDD8Q15843 RNU6ATAC22P-201ENST00000516794 89 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
NEDD8Q15843 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC-0.35□□□□□ -2.47
NEDD8Q15843 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
NEDD8Q15843 MTND4P33-201ENST00000556706 766 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
NEDD8Q15843 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC-0.35□□□□□ -2.47
NEDD8Q15843 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
NEDD8Q15843 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
NEDD8Q15843 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
NEDD8Q15843 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
NEDD8Q15843 AC010608.3-201ENST00000625048 527 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
NEDD8Q15843 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC-0.35□□□□□ -2.47
NEDD8Q15843 AC068137.4-201ENST00000638485 296 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
NEDD8Q15843 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
NEDD8Q15843 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
NEDD8Q15843 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
NEDD8Q15843 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
NEDD8Q15843 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
NEDD8Q15843 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
NEDD8Q15843 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
NEDD8Q15843 AC098592.1-201ENST00000419352 333 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
NEDD8Q15843 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
NEDD8Q15843 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
NEDD8Q15843 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
NEDD8Q15843 AC091996.1-201ENST00000522274 600 ntTSL 3 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
NEDD8Q15843 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
NEDD8Q15843 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
NEDD8Q15843 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
NEDD8Q15843 Clostridiales-1.4-201ENST00000636807 150 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
NEDD8Q15843 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.37□□□□□ -2.47
NEDD8Q15843 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
NEDD8Q15843 RNU6-929P-201ENST00000384429 107 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
NEDD8Q15843 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
NEDD8Q15843 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
NEDD8Q15843 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
NEDD8Q15843 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
NEDD8Q15843 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
NEDD8Q15843 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
NEDD8Q15843 MTND2P31-201ENST00000512602 616 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
NEDD8Q15843 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
NEDD8Q15843 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
NEDD8Q15843 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
NEDD8Q15843 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
NEDD8Q15843 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
NEDD8Q15843 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
NEDD8Q15843 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
NEDD8Q15843 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
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NEDD8Q15843 MIR593-201ENST00000384856 100 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
NEDD8Q15843 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
NEDD8Q15843 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
NEDD8Q15843 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
NEDD8Q15843 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
NEDD8Q15843 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
NEDD8Q15843 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
NEDD8Q15843 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
NEDD8Q15843 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
NEDD8Q15843 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
NEDD8Q15843 AP003168.1-201ENST00000530091 307 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
NEDD8Q15843 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
NEDD8Q15843 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
NEDD8Q15843 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
NEDD8Q15843 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
NEDD8Q15843 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
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