Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC0.27□□□□□ -2.37
VAMP3Q15836 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
VAMP3Q15836 AL158063.1-201ENST00000615349 536 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
VAMP3Q15836 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.26□□□□□ -2.37
VAMP3Q15836 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
VAMP3Q15836 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
VAMP3Q15836 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
VAMP3Q15836 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC0.26□□□□□ -2.37
VAMP3Q15836 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
VAMP3Q15836 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
VAMP3Q15836 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.26□□□□□ -2.37
VAMP3Q15836 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
VAMP3Q15836 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
VAMP3Q15836 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
VAMP3Q15836 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
VAMP3Q15836 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
VAMP3Q15836 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
VAMP3Q15836 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
VAMP3Q15836 AC092142.2-201ENST00000614642 354 ntTSL 3 BASIC0.26□□□□□ -2.37
VAMP3Q15836 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
VAMP3Q15836 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
VAMP3Q15836 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
VAMP3Q15836 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
VAMP3Q15836 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
VAMP3Q15836 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
VAMP3Q15836 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
VAMP3Q15836 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
VAMP3Q15836 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
VAMP3Q15836 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC0.25□□□□□ -2.37
VAMP3Q15836 AC022166.2-201ENST00000566030 536 ntTSL 4 BASIC0.25□□□□□ -2.37
VAMP3Q15836 MIR4528-201ENST00000577763 90 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
VAMP3Q15836 PIGPP4-201ENST00000584447 307 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
VAMP3Q15836 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
VAMP3Q15836 AL603755.1-201ENST00000619504 163 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
VAMP3Q15836 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
VAMP3Q15836 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC0.25□□□□□ -2.37
VAMP3Q15836 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
VAMP3Q15836 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
VAMP3Q15836 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
VAMP3Q15836 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC0.24□□□□□ -2.37
VAMP3Q15836 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC0.24□□□□□ -2.37
VAMP3Q15836 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
VAMP3Q15836 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC0.24□□□□□ -2.37
VAMP3Q15836 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
VAMP3Q15836 AC073648.5-201ENST00000603502 305 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
VAMP3Q15836 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC0.24□□□□□ -2.37
VAMP3Q15836 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
VAMP3Q15836 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
VAMP3Q15836 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
VAMP3Q15836 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
VAMP3Q15836 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
VAMP3Q15836 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
VAMP3Q15836 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
VAMP3Q15836 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
VAMP3Q15836 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
VAMP3Q15836 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
VAMP3Q15836 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
VAMP3Q15836 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
VAMP3Q15836 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
VAMP3Q15836 AP003086.2-201ENST00000534168 437 ntTSL 3 BASIC0.23□□□□□ -2.37
VAMP3Q15836 AC093424.1-201ENST00000604999 338 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
VAMP3Q15836 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
VAMP3Q15836 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
VAMP3Q15836 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
VAMP3Q15836 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
VAMP3Q15836 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
VAMP3Q15836 AL445567.1-201ENST00000439121 144 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
VAMP3Q15836 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC0.22□□□□□ -2.37
VAMP3Q15836 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
VAMP3Q15836 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
VAMP3Q15836 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
VAMP3Q15836 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
VAMP3Q15836 RN7SKP287-201ENST00000516546 266 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
VAMP3Q15836 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
VAMP3Q15836 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
VAMP3Q15836 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.22□□□□□ -2.37
VAMP3Q15836 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
VAMP3Q15836 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
VAMP3Q15836 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
VAMP3Q15836 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
VAMP3Q15836 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
VAMP3Q15836 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
VAMP3Q15836 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
VAMP3Q15836 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
VAMP3Q15836 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
VAMP3Q15836 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
VAMP3Q15836 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
VAMP3Q15836 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
VAMP3Q15836 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
VAMP3Q15836 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
VAMP3Q15836 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
VAMP3Q15836 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
VAMP3Q15836 SNORA72.3-201ENST00000365074 132 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
VAMP3Q15836 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
VAMP3Q15836 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
VAMP3Q15836 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
VAMP3Q15836 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
VAMP3Q15836 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
VAMP3Q15836 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC0.2□□□□□ -2.38
VAMP3Q15836 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.2 ms