Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
NCF4Q15080 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
NCF4Q15080 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC0.85□□□□□ -2.27
NCF4Q15080 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
NCF4Q15080 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
NCF4Q15080 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC0.84□□□□□ -2.27
NCF4Q15080 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
NCF4Q15080 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
NCF4Q15080 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.27
NCF4Q15080 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.27
NCF4Q15080 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
NCF4Q15080 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.27
NCF4Q15080 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
NCF4Q15080 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
NCF4Q15080 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
NCF4Q15080 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.27
NCF4Q15080 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
NCF4Q15080 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
NCF4Q15080 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
NCF4Q15080 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
NCF4Q15080 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC0.83□□□□□ -2.28
NCF4Q15080 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
NCF4Q15080 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
NCF4Q15080 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
NCF4Q15080 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
NCF4Q15080 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
NCF4Q15080 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
NCF4Q15080 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
NCF4Q15080 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
NCF4Q15080 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
NCF4Q15080 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC0.83□□□□□ -2.28
NCF4Q15080 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
NCF4Q15080 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
NCF4Q15080 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
NCF4Q15080 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
NCF4Q15080 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
NCF4Q15080 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
NCF4Q15080 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
NCF4Q15080 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
NCF4Q15080 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
NCF4Q15080 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
NCF4Q15080 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
NCF4Q15080 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.83□□□□□ -2.28
NCF4Q15080 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
NCF4Q15080 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
NCF4Q15080 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
NCF4Q15080 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
NCF4Q15080 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
NCF4Q15080 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
NCF4Q15080 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
NCF4Q15080 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
NCF4Q15080 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
NCF4Q15080 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
NCF4Q15080 AC004930.1-201ENST00000470677 254 ntTSL 2 BASIC0.82□□□□□ -2.28
NCF4Q15080 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
NCF4Q15080 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC0.82□□□□□ -2.28
NCF4Q15080 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
NCF4Q15080 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
NCF4Q15080 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
NCF4Q15080 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
NCF4Q15080 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
NCF4Q15080 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
NCF4Q15080 AC068137.4-201ENST00000638485 296 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
NCF4Q15080 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
NCF4Q15080 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
NCF4Q15080 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
NCF4Q15080 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
NCF4Q15080 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
NCF4Q15080 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
NCF4Q15080 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
NCF4Q15080 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
NCF4Q15080 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
NCF4Q15080 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
NCF4Q15080 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
NCF4Q15080 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
NCF4Q15080 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
NCF4Q15080 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
NCF4Q15080 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC0.81□□□□□ -2.28
NCF4Q15080 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
NCF4Q15080 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
NCF4Q15080 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC0.8□□□□□ -2.28
NCF4Q15080 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
NCF4Q15080 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
NCF4Q15080 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
NCF4Q15080 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC0.8□□□□□ -2.28
NCF4Q15080 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC0.8□□□□□ -2.28
NCF4Q15080 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
NCF4Q15080 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC0.8□□□□□ -2.28
NCF4Q15080 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
NCF4Q15080 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
NCF4Q15080 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
NCF4Q15080 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
NCF4Q15080 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
NCF4Q15080 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
NCF4Q15080 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
NCF4Q15080 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
NCF4Q15080 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
NCF4Q15080 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
NCF4Q15080 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
NCF4Q15080 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.3 ms