Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
BRD3Q15059 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
BRD3Q15059 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
BRD3Q15059 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
BRD3Q15059 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
BRD3Q15059 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
BRD3Q15059 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
BRD3Q15059 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
BRD3Q15059 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.11□□□□□ -2.07
BRD3Q15059 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
BRD3Q15059 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
BRD3Q15059 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
BRD3Q15059 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
BRD3Q15059 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
BRD3Q15059 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
BRD3Q15059 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
BRD3Q15059 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
BRD3Q15059 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
BRD3Q15059 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
BRD3Q15059 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
BRD3Q15059 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
BRD3Q15059 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
BRD3Q15059 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
BRD3Q15059 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
BRD3Q15059 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
BRD3Q15059 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
BRD3Q15059 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
BRD3Q15059 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
BRD3Q15059 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
BRD3Q15059 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
BRD3Q15059 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
BRD3Q15059 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
BRD3Q15059 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
BRD3Q15059 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
BRD3Q15059 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
BRD3Q15059 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
BRD3Q15059 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC2.1□□□□□ -2.07
BRD3Q15059 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
BRD3Q15059 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
BRD3Q15059 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
BRD3Q15059 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
BRD3Q15059 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
BRD3Q15059 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
BRD3Q15059 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
BRD3Q15059 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
BRD3Q15059 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
BRD3Q15059 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
BRD3Q15059 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
BRD3Q15059 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
BRD3Q15059 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
BRD3Q15059 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
BRD3Q15059 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
BRD3Q15059 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
BRD3Q15059 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
BRD3Q15059 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
BRD3Q15059 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
BRD3Q15059 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
BRD3Q15059 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
BRD3Q15059 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
BRD3Q15059 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
BRD3Q15059 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
BRD3Q15059 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
BRD3Q15059 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
BRD3Q15059 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
BRD3Q15059 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
BRD3Q15059 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
BRD3Q15059 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
BRD3Q15059 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
BRD3Q15059 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
BRD3Q15059 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
BRD3Q15059 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
BRD3Q15059 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
BRD3Q15059 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
BRD3Q15059 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
BRD3Q15059 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
BRD3Q15059 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
BRD3Q15059 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
BRD3Q15059 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
BRD3Q15059 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
BRD3Q15059 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC2.08□□□□□ -2.08
BRD3Q15059 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
BRD3Q15059 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
BRD3Q15059 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
BRD3Q15059 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
BRD3Q15059 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
BRD3Q15059 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
BRD3Q15059 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
BRD3Q15059 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
BRD3Q15059 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
BRD3Q15059 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
BRD3Q15059 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
BRD3Q15059 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC2.07□□□□□ -2.08
BRD3Q15059 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
BRD3Q15059 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
BRD3Q15059 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
BRD3Q15059 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
BRD3Q15059 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
BRD3Q15059 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
BRD3Q15059 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
BRD3Q15059 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85 ms