Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.36□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 TRAJ16-201ENST00000390521 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.36□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 MIR7851-201ENST00000610611 160 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC2.34□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ODF1Q14990 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
ODF1Q14990 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
ODF1Q14990 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
ODF1Q14990 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ODF1Q14990 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ODF1Q14990 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ODF1Q14990 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ODF1Q14990 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
ODF1Q14990 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
ODF1Q14990 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ODF1Q14990 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC2.33□□□□□ -2.04
ODF1Q14990 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
ODF1Q14990 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
ODF1Q14990 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ODF1Q14990 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
ODF1Q14990 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ODF1Q14990 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ODF1Q14990 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ODF1Q14990 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ODF1Q14990 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
ODF1Q14990 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
ODF1Q14990 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
ODF1Q14990 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ODF1Q14990 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ODF1Q14990 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ODF1Q14990 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ODF1Q14990 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ODF1Q14990 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ODF1Q14990 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ODF1Q14990 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ODF1Q14990 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
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