Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
COL9A3Q14050 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
COL9A3Q14050 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
COL9A3Q14050 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
COL9A3Q14050 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
COL9A3Q14050 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
COL9A3Q14050 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
COL9A3Q14050 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
COL9A3Q14050 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
COL9A3Q14050 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
COL9A3Q14050 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
COL9A3Q14050 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
COL9A3Q14050 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
COL9A3Q14050 SCN3A-201ENST00000283254 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
COL9A3Q14050 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
COL9A3Q14050 USP8P1-201ENST00000494673 3183 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
COL9A3Q14050 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
COL9A3Q14050 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.82
COL9A3Q14050 ERBIN-203ENST00000380938 4701 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.82
COL9A3Q14050 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
COL9A3Q14050 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
COL9A3Q14050 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
COL9A3Q14050 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
COL9A3Q14050 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
COL9A3Q14050 AC023141.12-201ENST00000512399 199 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
COL9A3Q14050 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
COL9A3Q14050 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
COL9A3Q14050 AL160262.1-201ENST00000522264 254 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
COL9A3Q14050 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
COL9A3Q14050 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
COL9A3Q14050 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
COL9A3Q14050 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
COL9A3Q14050 ATP7A-201ENST00000341514 8483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
COL9A3Q14050 WNK3-202ENST00000375159 5403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
COL9A3Q14050 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
COL9A3Q14050 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
COL9A3Q14050 C1orf112-203ENST00000413811 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
COL9A3Q14050 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
COL9A3Q14050 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
COL9A3Q14050 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
COL9A3Q14050 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
COL9A3Q14050 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
COL9A3Q14050 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
COL9A3Q14050 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
COL9A3Q14050 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
COL9A3Q14050 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
COL9A3Q14050 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
COL9A3Q14050 KMO-204ENST00000366559 5261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
COL9A3Q14050 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
COL9A3Q14050 PREPL-207ENST00000409957 4703 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
COL9A3Q14050 SETDB2-202ENST00000317257 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
COL9A3Q14050 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
COL9A3Q14050 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
COL9A3Q14050 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
COL9A3Q14050 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
COL9A3Q14050 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
COL9A3Q14050 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
COL9A3Q14050 IGLV5-37-201ENST00000390300 374 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
COL9A3Q14050 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
COL9A3Q14050 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
COL9A3Q14050 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
COL9A3Q14050 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
COL9A3Q14050 AC078817.1-201ENST00000492623 435 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
COL9A3Q14050 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
COL9A3Q14050 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
COL9A3Q14050 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
COL9A3Q14050 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
COL9A3Q14050 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
COL9A3Q14050 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
COL9A3Q14050 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
COL9A3Q14050 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
COL9A3Q14050 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
COL9A3Q14050 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
COL9A3Q14050 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
COL9A3Q14050 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
COL9A3Q14050 ADGRL2-210ENST00000370728 6302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
COL9A3Q14050 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
COL9A3Q14050 OR1C1-202ENST00000641256 3719 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
COL9A3Q14050 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
COL9A3Q14050 CEP170-202ENST00000366542 6828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
COL9A3Q14050 NLGN1-201ENST00000361589 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
COL9A3Q14050 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
COL9A3Q14050 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
COL9A3Q14050 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
COL9A3Q14050 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
COL9A3Q14050 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
COL9A3Q14050 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
COL9A3Q14050 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
COL9A3Q14050 Y_RNA.685-201ENST00000516532 108 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
COL9A3Q14050 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
COL9A3Q14050 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
COL9A3Q14050 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
COL9A3Q14050 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
COL9A3Q14050 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
COL9A3Q14050 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
COL9A3Q14050 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
COL9A3Q14050 RNU6-820P-201ENST00000384273 107 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
COL9A3Q14050 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
COL9A3Q14050 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
COL9A3Q14050 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
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