Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PKP1Q13835 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PKP1Q13835 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PKP1Q13835 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PKP1Q13835 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PKP1Q13835 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PKP1Q13835 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PKP1Q13835 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PKP1Q13835 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PKP1Q13835 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PKP1Q13835 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PKP1Q13835 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PKP1Q13835 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PKP1Q13835 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PKP1Q13835 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PKP1Q13835 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PKP1Q13835 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PKP1Q13835 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PKP1Q13835 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
PKP1Q13835 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
PKP1Q13835 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PKP1Q13835 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PKP1Q13835 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PKP1Q13835 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PKP1Q13835 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PKP1Q13835 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PKP1Q13835 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PKP1Q13835 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PKP1Q13835 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PKP1Q13835 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PKP1Q13835 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PKP1Q13835 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PKP1Q13835 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PKP1Q13835 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PKP1Q13835 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PKP1Q13835 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PKP1Q13835 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PKP1Q13835 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PKP1Q13835 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
PKP1Q13835 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
PKP1Q13835 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
PKP1Q13835 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
PKP1Q13835 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
PKP1Q13835 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
PKP1Q13835 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
PKP1Q13835 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PKP1Q13835 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PKP1Q13835 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PKP1Q13835 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PKP1Q13835 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PKP1Q13835 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PKP1Q13835 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
PKP1Q13835 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PKP1Q13835 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
PKP1Q13835 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
PKP1Q13835 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PKP1Q13835 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
PKP1Q13835 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
PKP1Q13835 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PKP1Q13835 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
PKP1Q13835 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PKP1Q13835 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PKP1Q13835 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PKP1Q13835 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PKP1Q13835 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PKP1Q13835 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PKP1Q13835 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
PKP1Q13835 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PKP1Q13835 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
PKP1Q13835 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PKP1Q13835 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PKP1Q13835 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PKP1Q13835 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
PKP1Q13835 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PKP1Q13835 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
PKP1Q13835 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
PKP1Q13835 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
PKP1Q13835 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
PKP1Q13835 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
PKP1Q13835 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PKP1Q13835 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PKP1Q13835 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PKP1Q13835 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PKP1Q13835 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PKP1Q13835 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PKP1Q13835 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PKP1Q13835 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PKP1Q13835 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PKP1Q13835 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PKP1Q13835 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PKP1Q13835 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PKP1Q13835 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PKP1Q13835 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
PKP1Q13835 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PKP1Q13835 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PKP1Q13835 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
PKP1Q13835 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
PKP1Q13835 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PKP1Q13835 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PKP1Q13835 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
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