Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
FOXE3Q13461 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
FOXE3Q13461 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
FOXE3Q13461 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
FOXE3Q13461 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
FOXE3Q13461 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
FOXE3Q13461 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
FOXE3Q13461 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
FOXE3Q13461 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
FOXE3Q13461 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
FOXE3Q13461 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
FOXE3Q13461 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
FOXE3Q13461 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
FOXE3Q13461 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
FOXE3Q13461 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
FOXE3Q13461 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
FOXE3Q13461 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
FOXE3Q13461 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
FOXE3Q13461 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
FOXE3Q13461 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
FOXE3Q13461 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
FOXE3Q13461 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
FOXE3Q13461 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
FOXE3Q13461 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
FOXE3Q13461 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
FOXE3Q13461 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
FOXE3Q13461 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
FOXE3Q13461 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
FOXE3Q13461 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
FOXE3Q13461 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
FOXE3Q13461 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
FOXE3Q13461 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
FOXE3Q13461 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
FOXE3Q13461 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
FOXE3Q13461 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
FOXE3Q13461 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
FOXE3Q13461 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
FOXE3Q13461 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
FOXE3Q13461 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
FOXE3Q13461 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
FOXE3Q13461 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
FOXE3Q13461 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
FOXE3Q13461 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
FOXE3Q13461 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
FOXE3Q13461 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
FOXE3Q13461 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
FOXE3Q13461 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
FOXE3Q13461 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
FOXE3Q13461 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
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FOXE3Q13461 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
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FOXE3Q13461 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
FOXE3Q13461 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
FOXE3Q13461 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
FOXE3Q13461 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
FOXE3Q13461 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
FOXE3Q13461 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
FOXE3Q13461 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
FOXE3Q13461 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
FOXE3Q13461 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
FOXE3Q13461 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
FOXE3Q13461 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
FOXE3Q13461 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
FOXE3Q13461 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
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FOXE3Q13461 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
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FOXE3Q13461 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
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FOXE3Q13461 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
FOXE3Q13461 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
FOXE3Q13461 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
FOXE3Q13461 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
FOXE3Q13461 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
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FOXE3Q13461 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
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FOXE3Q13461 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
FOXE3Q13461 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
FOXE3Q13461 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
FOXE3Q13461 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
FOXE3Q13461 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
FOXE3Q13461 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
FOXE3Q13461 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
FOXE3Q13461 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
FOXE3Q13461 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
FOXE3Q13461 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
FOXE3Q13461 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
FOXE3Q13461 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
FOXE3Q13461 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
FOXE3Q13461 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
FOXE3Q13461 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
FOXE3Q13461 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
FOXE3Q13461 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
FOXE3Q13461 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
FOXE3Q13461 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
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