Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
XRCC4Q13426 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
XRCC4Q13426 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
XRCC4Q13426 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
XRCC4Q13426 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
XRCC4Q13426 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
XRCC4Q13426 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
XRCC4Q13426 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
XRCC4Q13426 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
XRCC4Q13426 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
XRCC4Q13426 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
XRCC4Q13426 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
XRCC4Q13426 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
XRCC4Q13426 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC0.36□□□□□ -2.35
XRCC4Q13426 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
XRCC4Q13426 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
XRCC4Q13426 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
XRCC4Q13426 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
XRCC4Q13426 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
XRCC4Q13426 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
XRCC4Q13426 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
XRCC4Q13426 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
XRCC4Q13426 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
XRCC4Q13426 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
XRCC4Q13426 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
XRCC4Q13426 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
XRCC4Q13426 AL355997.1-202ENST00000454361 610 ntTSL 3 BASIC0.35□□□□□ -2.35
XRCC4Q13426 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
XRCC4Q13426 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
XRCC4Q13426 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
XRCC4Q13426 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
XRCC4Q13426 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
XRCC4Q13426 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC0.35□□□□□ -2.35
XRCC4Q13426 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC0.35□□□□□ -2.35
XRCC4Q13426 MIR4528-201ENST00000577763 90 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
XRCC4Q13426 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
XRCC4Q13426 Z94722.1-201ENST00000604328 474 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
XRCC4Q13426 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
XRCC4Q13426 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
XRCC4Q13426 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.35□□□□□ -2.35
XRCC4Q13426 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.34□□□□□ -2.35
XRCC4Q13426 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.34□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 RNU6-415P-201ENST00000516252 97 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC0.34□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC0.34□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 AL670729.3-201ENST00000602345 574 ntTSL 4 BASIC0.34□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC0.33□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC0.33□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC0.33□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC0.33□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC0.32□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC0.32□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 LINC02500-201ENST00000512547 493 ntTSL 3 BASIC0.32□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC0.32□□□□□ -2.36
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