Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SGCGQ13326 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SGCGQ13326 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SGCGQ13326 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SGCGQ13326 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SGCGQ13326 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SGCGQ13326 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SGCGQ13326 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SGCGQ13326 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SGCGQ13326 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SGCGQ13326 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SGCGQ13326 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SGCGQ13326 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
SGCGQ13326 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
SGCGQ13326 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SGCGQ13326 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SGCGQ13326 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SGCGQ13326 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SGCGQ13326 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
SGCGQ13326 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SGCGQ13326 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SGCGQ13326 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SGCGQ13326 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SGCGQ13326 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SGCGQ13326 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SGCGQ13326 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SGCGQ13326 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SGCGQ13326 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SGCGQ13326 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SGCGQ13326 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
SGCGQ13326 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
SGCGQ13326 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SGCGQ13326 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SGCGQ13326 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SGCGQ13326 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
SGCGQ13326 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SGCGQ13326 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SGCGQ13326 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SGCGQ13326 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SGCGQ13326 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SGCGQ13326 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
SGCGQ13326 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
SGCGQ13326 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
SGCGQ13326 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SGCGQ13326 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SGCGQ13326 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SGCGQ13326 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SGCGQ13326 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.69□□□□□ -2.14
SGCGQ13326 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SGCGQ13326 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SGCGQ13326 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
SGCGQ13326 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
SGCGQ13326 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SGCGQ13326 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SGCGQ13326 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SGCGQ13326 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SGCGQ13326 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
SGCGQ13326 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SGCGQ13326 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SGCGQ13326 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SGCGQ13326 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SGCGQ13326 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SGCGQ13326 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SGCGQ13326 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SGCGQ13326 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SGCGQ13326 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SGCGQ13326 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SGCGQ13326 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SGCGQ13326 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
SGCGQ13326 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SGCGQ13326 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SGCGQ13326 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SGCGQ13326 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SGCGQ13326 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SGCGQ13326 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SGCGQ13326 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SGCGQ13326 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SGCGQ13326 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SGCGQ13326 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SGCGQ13326 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SGCGQ13326 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SGCGQ13326 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SGCGQ13326 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SGCGQ13326 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SGCGQ13326 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SGCGQ13326 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SGCGQ13326 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SGCGQ13326 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SGCGQ13326 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SGCGQ13326 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SGCGQ13326 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SGCGQ13326 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SGCGQ13326 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SGCGQ13326 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SGCGQ13326 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SGCGQ13326 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SGCGQ13326 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SGCGQ13326 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SGCGQ13326 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SGCGQ13326 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 249.5 ms