Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TRAF3Q13114 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
TRAF3Q13114 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
TRAF3Q13114 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
TRAF3Q13114 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TRAF3Q13114 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TRAF3Q13114 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
TRAF3Q13114 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
TRAF3Q13114 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TRAF3Q13114 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TRAF3Q13114 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TRAF3Q13114 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TRAF3Q13114 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TRAF3Q13114 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
TRAF3Q13114 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TRAF3Q13114 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
TRAF3Q13114 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
TRAF3Q13114 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TRAF3Q13114 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TRAF3Q13114 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TRAF3Q13114 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
TRAF3Q13114 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
TRAF3Q13114 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
TRAF3Q13114 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TRAF3Q13114 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TRAF3Q13114 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TRAF3Q13114 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TRAF3Q13114 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TRAF3Q13114 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TRAF3Q13114 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TRAF3Q13114 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TRAF3Q13114 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TRAF3Q13114 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TRAF3Q13114 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
TRAF3Q13114 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
TRAF3Q13114 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TRAF3Q13114 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC2.12□□□□□ -2.07
TRAF3Q13114 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TRAF3Q13114 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TRAF3Q13114 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TRAF3Q13114 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TRAF3Q13114 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.11□□□□□ -2.07
TRAF3Q13114 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
TRAF3Q13114 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TRAF3Q13114 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TRAF3Q13114 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TRAF3Q13114 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TRAF3Q13114 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TRAF3Q13114 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TRAF3Q13114 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TRAF3Q13114 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
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TRAF3Q13114 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TRAF3Q13114 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TRAF3Q13114 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TRAF3Q13114 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TRAF3Q13114 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TRAF3Q13114 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
TRAF3Q13114 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
TRAF3Q13114 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
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TRAF3Q13114 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
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TRAF3Q13114 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TRAF3Q13114 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TRAF3Q13114 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
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TRAF3Q13114 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
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TRAF3Q13114 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
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TRAF3Q13114 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
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TRAF3Q13114 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TRAF3Q13114 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
TRAF3Q13114 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
TRAF3Q13114 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC2.09□□□□□ -2.07
TRAF3Q13114 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TRAF3Q13114 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TRAF3Q13114 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TRAF3Q13114 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TRAF3Q13114 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TRAF3Q13114 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TRAF3Q13114 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TRAF3Q13114 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TRAF3Q13114 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TRAF3Q13114 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TRAF3Q13114 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TRAF3Q13114 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TRAF3Q13114 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
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