Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
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TRAF1Q13077 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
TRAF1Q13077 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
TRAF1Q13077 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
TRAF1Q13077 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TRAF1Q13077 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TRAF1Q13077 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TRAF1Q13077 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TRAF1Q13077 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TRAF1Q13077 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TRAF1Q13077 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TRAF1Q13077 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
TRAF1Q13077 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
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TRAF1Q13077 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TRAF1Q13077 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
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TRAF1Q13077 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TRAF1Q13077 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
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TRAF1Q13077 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TRAF1Q13077 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TRAF1Q13077 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
TRAF1Q13077 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
TRAF1Q13077 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
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TRAF1Q13077 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TRAF1Q13077 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
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TRAF1Q13077 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
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TRAF1Q13077 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
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TRAF1Q13077 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
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TRAF1Q13077 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TRAF1Q13077 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
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TRAF1Q13077 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
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TRAF1Q13077 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TRAF1Q13077 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
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TRAF1Q13077 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TRAF1Q13077 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TRAF1Q13077 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
TRAF1Q13077 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
TRAF1Q13077 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
TRAF1Q13077 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
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