Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RBBP4Q09028 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
RBBP4Q09028 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RBBP4Q09028 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RBBP4Q09028 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
RBBP4Q09028 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RBBP4Q09028 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RBBP4Q09028 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RBBP4Q09028 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.51□□□□□ -2.17
RBBP4Q09028 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RBBP4Q09028 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RBBP4Q09028 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RBBP4Q09028 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RBBP4Q09028 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RBBP4Q09028 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
RBBP4Q09028 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
RBBP4Q09028 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RBBP4Q09028 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RBBP4Q09028 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RBBP4Q09028 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RBBP4Q09028 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RBBP4Q09028 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RBBP4Q09028 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
RBBP4Q09028 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RBBP4Q09028 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RBBP4Q09028 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
RBBP4Q09028 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RBBP4Q09028 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RBBP4Q09028 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
RBBP4Q09028 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RBBP4Q09028 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RBBP4Q09028 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RBBP4Q09028 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RBBP4Q09028 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC1.49□□□□□ -2.17
RBBP4Q09028 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
RBBP4Q09028 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
RBBP4Q09028 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RBBP4Q09028 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RBBP4Q09028 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RBBP4Q09028 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RBBP4Q09028 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RBBP4Q09028 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
RBBP4Q09028 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
RBBP4Q09028 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RBBP4Q09028 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RBBP4Q09028 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RBBP4Q09028 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RBBP4Q09028 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RBBP4Q09028 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RBBP4Q09028 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RBBP4Q09028 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RBBP4Q09028 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RBBP4Q09028 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RBBP4Q09028 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RBBP4Q09028 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RBBP4Q09028 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RBBP4Q09028 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RBBP4Q09028 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RBBP4Q09028 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RBBP4Q09028 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RBBP4Q09028 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RBBP4Q09028 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RBBP4Q09028 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RBBP4Q09028 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RBBP4Q09028 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RBBP4Q09028 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RBBP4Q09028 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
RBBP4Q09028 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RBBP4Q09028 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
RBBP4Q09028 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RBBP4Q09028 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RBBP4Q09028 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
RBBP4Q09028 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
RBBP4Q09028 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
RBBP4Q09028 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
RBBP4Q09028 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
RBBP4Q09028 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
RBBP4Q09028 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
RBBP4Q09028 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
RBBP4Q09028 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
RBBP4Q09028 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
RBBP4Q09028 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
RBBP4Q09028 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
RBBP4Q09028 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
RBBP4Q09028 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
RBBP4Q09028 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
RBBP4Q09028 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
RBBP4Q09028 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
RBBP4Q09028 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
RBBP4Q09028 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
RBBP4Q09028 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
RBBP4Q09028 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.4 ms