Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 MTCO2P7-201ENST00000446518 666 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
CENPFP49454 AC018714.1-201ENST00000605028 208 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
CENPFP49454 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
CENPFP49454 MT-TP-201ENST00000387461 68 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
CENPFP49454 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
CENPFP49454 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
CENPFP49454 AC234772.3-201ENST00000602277 528 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
CENPFP49454 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
CENPFP49454 AC121247.2-201ENST00000604776 136 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
CENPFP49454 AC107952.2-201ENST00000606048 486 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
CENPFP49454 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
CENPFP49454 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
CENPFP49454 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
CENPFP49454 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
CENPFP49454 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
CENPFP49454 SMAD5-AS1_3.1-201ENST00000614187 124 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
CENPFP49454 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
CENPFP49454 RNU6-164P-201ENST00000364604 103 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
CENPFP49454 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
CENPFP49454 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC-1.96□□□□□ -2.72
CENPFP49454 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
CENPFP49454 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
CENPFP49454 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
CENPFP49454 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
CENPFP49454 AC009269.6-201ENST00000621778 588 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
CENPFP49454 RNU6-621P-201ENST00000364752 109 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
CENPFP49454 Y_RNA.513-201ENST00000384522 100 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
CENPFP49454 AC099520.1-205ENST00000524083 316 ntTSL 3 BASIC-1.96□□□□□ -2.72
CENPFP49454 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
CENPFP49454 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
CENPFP49454 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
CENPFP49454 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
CENPFP49454 MIR487B-201ENST00000385021 84 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
CENPFP49454 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
CENPFP49454 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
CENPFP49454 AC253576.2-201ENST00000618815 580 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
CENPFP49454 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.73
CENPFP49454 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC-1.97□□□□□ -2.73
CENPFP49454 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.73
CENPFP49454 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
CENPFP49454 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
CENPFP49454 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
CENPFP49454 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC-1.98□□□□□ -2.73
CENPFP49454 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
CENPFP49454 RNU5E-10P-201ENST00000363506 118 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
CENPFP49454 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
CENPFP49454 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
CENPFP49454 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
CENPFP49454 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC-1.98□□□□□ -2.73
CENPFP49454 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
CENPFP49454 AC090772.4-201ENST00000623599 362 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
CENPFP49454 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
CENPFP49454 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC-1.98□□□□□ -2.73
CENPFP49454 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
CENPFP49454 MIR7-1-201ENST00000384871 110 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
CENPFP49454 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
CENPFP49454 LINC02484-201ENST00000513843 546 ntTSL 5 BASIC-1.99□□□□□ -2.73
CENPFP49454 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
CENPFP49454 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
CENPFP49454 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
CENPFP49454 RNU5A-7P-201ENST00000515979 116 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
CENPFP49454 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
CENPFP49454 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
CENPFP49454 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
CENPFP49454 AC103810.2-203ENST00000584959 631 ntTSL 5 BASIC-1.99□□□□□ -2.73
CENPFP49454 AL358072.1-201ENST00000604156 575 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
CENPFP49454 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
CENPFP49454 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC-2□□□□□ -2.73
CENPFP49454 AC036101.1-201ENST00000449272 597 ntTSL 3 BASIC-2□□□□□ -2.73
CENPFP49454 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
CENPFP49454 AC055876.5-201ENST00000605667 259 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
CENPFP49454 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
CENPFP49454 AL589994.1-201ENST00000404962 340 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
CENPFP49454 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC-2□□□□□ -2.73
CENPFP49454 AL118556.1-201ENST00000555257 502 ntTSL 2 BASIC-2□□□□□ -2.73
CENPFP49454 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
CENPFP49454 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC-2□□□□□ -2.73
CENPFP49454 Y_RNA.175-201ENST00000363794 111 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
CENPFP49454 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
CENPFP49454 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
CENPFP49454 RNU6-230P-201ENST00000362457 104 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
CENPFP49454 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
CENPFP49454 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
CENPFP49454 SNORD74.6-201ENST00000364796 70 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
CENPFP49454 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
CENPFP49454 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
CENPFP49454 RNU6-1151P-201ENST00000384684 107 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
CENPFP49454 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC-2.01□□□□□ -2.73
CENPFP49454 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
CENPFP49454 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC-2.01□□□□□ -2.73
CENPFP49454 AC091059.1-201ENST00000585190 215 ntTSL 3 BASIC-2.01□□□□□ -2.73
CENPFP49454 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
CENPFP49454 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
CENPFP49454 RNU7-27P-201ENST00000459281 62 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
CENPFP49454 RNY4P9-201ENST00000363194 97 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
CENPFP49454 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
CENPFP49454 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
CENPFP49454 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
CENPFP49454 MIR320B1-201ENST00000390209 79 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
CENPFP49454 GRM7-AS3-203ENST00000424366 486 ntTSL 3 BASIC-2.02□□□□□ -2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.2 ms