Protein–RNA interactions for Protein: O14717

TRDMT1, tRNA (cytosine(38)-C(5))-methyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDMT1O14717 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TRDMT1O14717 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TRDMT1O14717 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TRDMT1O14717 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TRDMT1O14717 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TRDMT1O14717 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TRDMT1O14717 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TRDMT1O14717 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TRDMT1O14717 MTCO2P7-201ENST00000446518 666 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TRDMT1O14717 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
TRDMT1O14717 LINC02500-201ENST00000512547 493 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
TRDMT1O14717 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TRDMT1O14717 LRRC34P1-201ENST00000542742 915 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TRDMT1O14717 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TRDMT1O14717 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TRDMT1O14717 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TRDMT1O14717 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TRDMT1O14717 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.64□□□□□ -2.31
TRDMT1O14717 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TRDMT1O14717 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.63□□□□□ -2.31
TRDMT1O14717 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TRDMT1O14717 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TRDMT1O14717 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TRDMT1O14717 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TRDMT1O14717 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TRDMT1O14717 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TRDMT1O14717 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC0.63□□□□□ -2.31
TRDMT1O14717 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TRDMT1O14717 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TRDMT1O14717 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TRDMT1O14717 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TRDMT1O14717 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TRDMT1O14717 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TRDMT1O14717 AC068137.4-201ENST00000638485 296 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TRDMT1O14717 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TRDMT1O14717 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TRDMT1O14717 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TRDMT1O14717 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TRDMT1O14717 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TRDMT1O14717 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
TRDMT1O14717 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TRDMT1O14717 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TRDMT1O14717 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TRDMT1O14717 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TRDMT1O14717 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TRDMT1O14717 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TRDMT1O14717 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC0.62□□□□□ -2.31
TRDMT1O14717 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
TRDMT1O14717 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TRDMT1O14717 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TRDMT1O14717 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TRDMT1O14717 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TRDMT1O14717 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TRDMT1O14717 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TRDMT1O14717 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TRDMT1O14717 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TRDMT1O14717 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TRDMT1O14717 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC0.61□□□□□ -2.31
TRDMT1O14717 AC092447.3-201ENST00000426027 686 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TRDMT1O14717 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TRDMT1O14717 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC0.61□□□□□ -2.31
TRDMT1O14717 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TRDMT1O14717 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TRDMT1O14717 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TRDMT1O14717 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TRDMT1O14717 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TRDMT1O14717 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TRDMT1O14717 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TRDMT1O14717 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC0.61□□□□□ -2.31
TRDMT1O14717 PIGPP4-201ENST00000584447 307 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TRDMT1O14717 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC0.6□□□□□ -2.31
TRDMT1O14717 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TRDMT1O14717 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TRDMT1O14717 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TRDMT1O14717 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TRDMT1O14717 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TRDMT1O14717 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TRDMT1O14717 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TRDMT1O14717 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TRDMT1O14717 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC0.6□□□□□ -2.31
TRDMT1O14717 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TRDMT1O14717 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TRDMT1O14717 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TRDMT1O14717 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TRDMT1O14717 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TRDMT1O14717 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TRDMT1O14717 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TRDMT1O14717 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TRDMT1O14717 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TRDMT1O14717 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TRDMT1O14717 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TRDMT1O14717 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TRDMT1O14717 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TRDMT1O14717 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TRDMT1O14717 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC0.59□□□□□ -2.31
TRDMT1O14717 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TRDMT1O14717 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TRDMT1O14717 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC0.59□□□□□ -2.31
TRDMT1O14717 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC0.59□□□□□ -2.31
TRDMT1O14717 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.8 ms