Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
USP35Q9P2H5 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC3□□□□□ -1.93
USP35Q9P2H5 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC3□□□□□ -1.93
USP35Q9P2H5 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC3□□□□□ -1.93
USP35Q9P2H5 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC3□□□□□ -1.93
USP35Q9P2H5 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
USP35Q9P2H5 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
USP35Q9P2H5 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
USP35Q9P2H5 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
USP35Q9P2H5 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
USP35Q9P2H5 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
USP35Q9P2H5 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
USP35Q9P2H5 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
USP35Q9P2H5 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
USP35Q9P2H5 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
USP35Q9P2H5 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
USP35Q9P2H5 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
USP35Q9P2H5 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
USP35Q9P2H5 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
USP35Q9P2H5 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
USP35Q9P2H5 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
USP35Q9P2H5 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
USP35Q9P2H5 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
USP35Q9P2H5 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
USP35Q9P2H5 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
USP35Q9P2H5 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
USP35Q9P2H5 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
USP35Q9P2H5 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
USP35Q9P2H5 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
USP35Q9P2H5 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
USP35Q9P2H5 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
USP35Q9P2H5 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
USP35Q9P2H5 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
USP35Q9P2H5 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
USP35Q9P2H5 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
USP35Q9P2H5 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
USP35Q9P2H5 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
USP35Q9P2H5 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
USP35Q9P2H5 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
USP35Q9P2H5 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
USP35Q9P2H5 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
USP35Q9P2H5 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
USP35Q9P2H5 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
USP35Q9P2H5 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
USP35Q9P2H5 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
USP35Q9P2H5 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
USP35Q9P2H5 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
USP35Q9P2H5 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
USP35Q9P2H5 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
USP35Q9P2H5 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
USP35Q9P2H5 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
USP35Q9P2H5 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
USP35Q9P2H5 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
USP35Q9P2H5 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC2.97□□□□□ -1.93
USP35Q9P2H5 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
USP35Q9P2H5 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
USP35Q9P2H5 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
USP35Q9P2H5 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
USP35Q9P2H5 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
USP35Q9P2H5 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
USP35Q9P2H5 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
USP35Q9P2H5 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
USP35Q9P2H5 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
USP35Q9P2H5 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
USP35Q9P2H5 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
USP35Q9P2H5 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
USP35Q9P2H5 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
USP35Q9P2H5 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
USP35Q9P2H5 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
USP35Q9P2H5 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
USP35Q9P2H5 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
USP35Q9P2H5 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
USP35Q9P2H5 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
USP35Q9P2H5 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
USP35Q9P2H5 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
USP35Q9P2H5 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
USP35Q9P2H5 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
USP35Q9P2H5 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
USP35Q9P2H5 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
USP35Q9P2H5 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
USP35Q9P2H5 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
USP35Q9P2H5 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
USP35Q9P2H5 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
USP35Q9P2H5 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
USP35Q9P2H5 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
USP35Q9P2H5 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
USP35Q9P2H5 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
USP35Q9P2H5 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
USP35Q9P2H5 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
USP35Q9P2H5 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
USP35Q9P2H5 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
USP35Q9P2H5 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
USP35Q9P2H5 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
USP35Q9P2H5 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
USP35Q9P2H5 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
USP35Q9P2H5 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
USP35Q9P2H5 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
USP35Q9P2H5 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
USP35Q9P2H5 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
USP35Q9P2H5 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
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