Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SRRTQ9BXP5 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SRRTQ9BXP5 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SRRTQ9BXP5 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SRRTQ9BXP5 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SRRTQ9BXP5 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SRRTQ9BXP5 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SRRTQ9BXP5 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SRRTQ9BXP5 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SRRTQ9BXP5 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SRRTQ9BXP5 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SRRTQ9BXP5 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SRRTQ9BXP5 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SRRTQ9BXP5 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SRRTQ9BXP5 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
SRRTQ9BXP5 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SRRTQ9BXP5 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SRRTQ9BXP5 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SRRTQ9BXP5 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SRRTQ9BXP5 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SRRTQ9BXP5 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SRRTQ9BXP5 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SRRTQ9BXP5 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SRRTQ9BXP5 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SRRTQ9BXP5 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SRRTQ9BXP5 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SRRTQ9BXP5 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SRRTQ9BXP5 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SRRTQ9BXP5 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SRRTQ9BXP5 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SRRTQ9BXP5 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SRRTQ9BXP5 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SRRTQ9BXP5 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SRRTQ9BXP5 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SRRTQ9BXP5 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SRRTQ9BXP5 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SRRTQ9BXP5 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SRRTQ9BXP5 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SRRTQ9BXP5 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SRRTQ9BXP5 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SRRTQ9BXP5 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SRRTQ9BXP5 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SRRTQ9BXP5 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SRRTQ9BXP5 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SRRTQ9BXP5 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
SRRTQ9BXP5 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SRRTQ9BXP5 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SRRTQ9BXP5 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SRRTQ9BXP5 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SRRTQ9BXP5 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SRRTQ9BXP5 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SRRTQ9BXP5 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SRRTQ9BXP5 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SRRTQ9BXP5 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SRRTQ9BXP5 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SRRTQ9BXP5 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SRRTQ9BXP5 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SRRTQ9BXP5 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
SRRTQ9BXP5 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
SRRTQ9BXP5 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SRRTQ9BXP5 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SRRTQ9BXP5 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SRRTQ9BXP5 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SRRTQ9BXP5 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SRRTQ9BXP5 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
SRRTQ9BXP5 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SRRTQ9BXP5 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SRRTQ9BXP5 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SRRTQ9BXP5 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SRRTQ9BXP5 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SRRTQ9BXP5 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SRRTQ9BXP5 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SRRTQ9BXP5 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SRRTQ9BXP5 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SRRTQ9BXP5 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
SRRTQ9BXP5 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SRRTQ9BXP5 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
SRRTQ9BXP5 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SRRTQ9BXP5 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SRRTQ9BXP5 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SRRTQ9BXP5 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SRRTQ9BXP5 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SRRTQ9BXP5 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SRRTQ9BXP5 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SRRTQ9BXP5 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SRRTQ9BXP5 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SRRTQ9BXP5 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SRRTQ9BXP5 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SRRTQ9BXP5 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SRRTQ9BXP5 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SRRTQ9BXP5 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SRRTQ9BXP5 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SRRTQ9BXP5 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SRRTQ9BXP5 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SRRTQ9BXP5 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SRRTQ9BXP5 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SRRTQ9BXP5 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SRRTQ9BXP5 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SRRTQ9BXP5 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SRRTQ9BXP5 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.6 ms