Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.1 ms