Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ZBED3Q96IU2 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
ZBED3Q96IU2 MTCO2P7-201ENST00000446518 666 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ZBED3Q96IU2 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ZBED3Q96IU2 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ZBED3Q96IU2 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ZBED3Q96IU2 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ZBED3Q96IU2 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
ZBED3Q96IU2 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ZBED3Q96IU2 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ZBED3Q96IU2 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ZBED3Q96IU2 AC097065.2-201ENST00000608159 533 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ZBED3Q96IU2 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
ZBED3Q96IU2 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ZBED3Q96IU2 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
ZBED3Q96IU2 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
ZBED3Q96IU2 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ZBED3Q96IU2 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ZBED3Q96IU2 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ZBED3Q96IU2 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ZBED3Q96IU2 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ZBED3Q96IU2 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ZBED3Q96IU2 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
ZBED3Q96IU2 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
ZBED3Q96IU2 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ZBED3Q96IU2 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ZBED3Q96IU2 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
ZBED3Q96IU2 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ZBED3Q96IU2 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ZBED3Q96IU2 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ZBED3Q96IU2 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ZBED3Q96IU2 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ZBED3Q96IU2 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
ZBED3Q96IU2 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ZBED3Q96IU2 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ZBED3Q96IU2 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ZBED3Q96IU2 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ZBED3Q96IU2 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ZBED3Q96IU2 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ZBED3Q96IU2 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ZBED3Q96IU2 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ZBED3Q96IU2 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ZBED3Q96IU2 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ZBED3Q96IU2 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ZBED3Q96IU2 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ZBED3Q96IU2 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ZBED3Q96IU2 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ZBED3Q96IU2 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ZBED3Q96IU2 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
ZBED3Q96IU2 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ZBED3Q96IU2 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
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ZBED3Q96IU2 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
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ZBED3Q96IU2 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ZBED3Q96IU2 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
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ZBED3Q96IU2 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
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ZBED3Q96IU2 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
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ZBED3Q96IU2 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
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ZBED3Q96IU2 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ZBED3Q96IU2 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
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ZBED3Q96IU2 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ZBED3Q96IU2 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
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ZBED3Q96IU2 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
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ZBED3Q96IU2 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
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ZBED3Q96IU2 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
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ZBED3Q96IU2 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC0.9□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC0.9□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC0.9□□□□□ -2.27
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