Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC0.93□□□□□ -2.26
FAM3DQ96BQ1 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
FAM3DQ96BQ1 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
FAM3DQ96BQ1 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
FAM3DQ96BQ1 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
FAM3DQ96BQ1 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
FAM3DQ96BQ1 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
FAM3DQ96BQ1 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
FAM3DQ96BQ1 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
FAM3DQ96BQ1 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
FAM3DQ96BQ1 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
FAM3DQ96BQ1 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
FAM3DQ96BQ1 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
FAM3DQ96BQ1 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
FAM3DQ96BQ1 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
FAM3DQ96BQ1 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
FAM3DQ96BQ1 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
FAM3DQ96BQ1 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
FAM3DQ96BQ1 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
FAM3DQ96BQ1 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
FAM3DQ96BQ1 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
FAM3DQ96BQ1 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
FAM3DQ96BQ1 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
FAM3DQ96BQ1 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
FAM3DQ96BQ1 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
FAM3DQ96BQ1 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
FAM3DQ96BQ1 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
FAM3DQ96BQ1 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
FAM3DQ96BQ1 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
FAM3DQ96BQ1 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC0.92□□□□□ -2.26
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
FAM3DQ96BQ1 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
FAM3DQ96BQ1 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
FAM3DQ96BQ1 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
FAM3DQ96BQ1 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
FAM3DQ96BQ1 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
FAM3DQ96BQ1 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
FAM3DQ96BQ1 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
FAM3DQ96BQ1 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
FAM3DQ96BQ1 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
FAM3DQ96BQ1 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
FAM3DQ96BQ1 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
FAM3DQ96BQ1 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
FAM3DQ96BQ1 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
FAM3DQ96BQ1 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
FAM3DQ96BQ1 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
FAM3DQ96BQ1 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC0.91□□□□□ -2.26
FAM3DQ96BQ1 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
FAM3DQ96BQ1 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
FAM3DQ96BQ1 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
FAM3DQ96BQ1 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
FAM3DQ96BQ1 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
FAM3DQ96BQ1 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
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FAM3DQ96BQ1 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
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FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
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FAM3DQ96BQ1 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.27
FAM3DQ96BQ1 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC0.89□□□□□ -2.27
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FAM3DQ96BQ1 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
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FAM3DQ96BQ1 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
FAM3DQ96BQ1 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
FAM3DQ96BQ1 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
FAM3DQ96BQ1 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
FAM3DQ96BQ1 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
FAM3DQ96BQ1 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
FAM3DQ96BQ1 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
FAM3DQ96BQ1 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
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