Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4Q7

CNNM4, Metal transporter CNNM4, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM4Q6P4Q7 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CNNM4Q6P4Q7 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CNNM4Q6P4Q7 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CNNM4Q6P4Q7 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CNNM4Q6P4Q7 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CNNM4Q6P4Q7 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CNNM4Q6P4Q7 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CNNM4Q6P4Q7 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CNNM4Q6P4Q7 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CNNM4Q6P4Q7 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CNNM4Q6P4Q7 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CNNM4Q6P4Q7 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CNNM4Q6P4Q7 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
CNNM4Q6P4Q7 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
CNNM4Q6P4Q7 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CNNM4Q6P4Q7 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
CNNM4Q6P4Q7 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CNNM4Q6P4Q7 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CNNM4Q6P4Q7 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CNNM4Q6P4Q7 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CNNM4Q6P4Q7 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CNNM4Q6P4Q7 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CNNM4Q6P4Q7 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CNNM4Q6P4Q7 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CNNM4Q6P4Q7 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CNNM4Q6P4Q7 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CNNM4Q6P4Q7 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CNNM4Q6P4Q7 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CNNM4Q6P4Q7 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CNNM4Q6P4Q7 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CNNM4Q6P4Q7 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CNNM4Q6P4Q7 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CNNM4Q6P4Q7 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CNNM4Q6P4Q7 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CNNM4Q6P4Q7 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CNNM4Q6P4Q7 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CNNM4Q6P4Q7 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CNNM4Q6P4Q7 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CNNM4Q6P4Q7 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CNNM4Q6P4Q7 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CNNM4Q6P4Q7 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CNNM4Q6P4Q7 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CNNM4Q6P4Q7 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CNNM4Q6P4Q7 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CNNM4Q6P4Q7 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CNNM4Q6P4Q7 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CNNM4Q6P4Q7 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CNNM4Q6P4Q7 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CNNM4Q6P4Q7 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CNNM4Q6P4Q7 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CNNM4Q6P4Q7 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CNNM4Q6P4Q7 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CNNM4Q6P4Q7 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CNNM4Q6P4Q7 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CNNM4Q6P4Q7 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CNNM4Q6P4Q7 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CNNM4Q6P4Q7 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CNNM4Q6P4Q7 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CNNM4Q6P4Q7 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CNNM4Q6P4Q7 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CNNM4Q6P4Q7 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CNNM4Q6P4Q7 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CNNM4Q6P4Q7 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CNNM4Q6P4Q7 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
CNNM4Q6P4Q7 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CNNM4Q6P4Q7 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CNNM4Q6P4Q7 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CNNM4Q6P4Q7 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CNNM4Q6P4Q7 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CNNM4Q6P4Q7 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CNNM4Q6P4Q7 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CNNM4Q6P4Q7 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CNNM4Q6P4Q7 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CNNM4Q6P4Q7 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CNNM4Q6P4Q7 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CNNM4Q6P4Q7 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CNNM4Q6P4Q7 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CNNM4Q6P4Q7 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CNNM4Q6P4Q7 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CNNM4Q6P4Q7 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CNNM4Q6P4Q7 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CNNM4Q6P4Q7 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CNNM4Q6P4Q7 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CNNM4Q6P4Q7 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CNNM4Q6P4Q7 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CNNM4Q6P4Q7 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CNNM4Q6P4Q7 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CNNM4Q6P4Q7 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CNNM4Q6P4Q7 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CNNM4Q6P4Q7 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CNNM4Q6P4Q7 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CNNM4Q6P4Q7 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
CNNM4Q6P4Q7 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CNNM4Q6P4Q7 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CNNM4Q6P4Q7 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CNNM4Q6P4Q7 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CNNM4Q6P4Q7 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
CNNM4Q6P4Q7 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CNNM4Q6P4Q7 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
CNNM4Q6P4Q7 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.1 ms