Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ME3Q16798 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ME3Q16798 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
ME3Q16798 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ME3Q16798 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ME3Q16798 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ME3Q16798 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ME3Q16798 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ME3Q16798 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ME3Q16798 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ME3Q16798 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ME3Q16798 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
ME3Q16798 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
ME3Q16798 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ME3Q16798 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ME3Q16798 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ME3Q16798 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
ME3Q16798 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
ME3Q16798 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
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ME3Q16798 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ME3Q16798 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ME3Q16798 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ME3Q16798 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
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ME3Q16798 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ME3Q16798 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ME3Q16798 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ME3Q16798 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
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ME3Q16798 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC2.18□□□□□ -2.06
ME3Q16798 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
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ME3Q16798 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ME3Q16798 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ME3Q16798 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ME3Q16798 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
ME3Q16798 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
ME3Q16798 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ME3Q16798 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ME3Q16798 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
ME3Q16798 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
ME3Q16798 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ME3Q16798 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ME3Q16798 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ME3Q16798 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
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ME3Q16798 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ME3Q16798 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ME3Q16798 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
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ME3Q16798 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ME3Q16798 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ME3Q16798 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ME3Q16798 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ME3Q16798 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ME3Q16798 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ME3Q16798 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ME3Q16798 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ME3Q16798 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
ME3Q16798 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ME3Q16798 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ME3Q16798 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ME3Q16798 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ME3Q16798 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC2.16□□□□□ -2.06
ME3Q16798 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ME3Q16798 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ME3Q16798 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
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ME3Q16798 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
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ME3Q16798 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ME3Q16798 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
ME3Q16798 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ME3Q16798 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
ME3Q16798 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
ME3Q16798 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
ME3Q16798 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
ME3Q16798 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
ME3Q16798 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
ME3Q16798 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ME3Q16798 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ME3Q16798 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ME3Q16798 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ME3Q16798 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
ME3Q16798 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ME3Q16798 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ME3Q16798 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ME3Q16798 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ME3Q16798 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ME3Q16798 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ME3Q16798 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ME3Q16798 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ME3Q16798 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ME3Q16798 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ME3Q16798 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ME3Q16798 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
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