Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
FXNQ16595 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
FXNQ16595 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
FXNQ16595 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
FXNQ16595 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
FXNQ16595 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
FXNQ16595 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
FXNQ16595 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
FXNQ16595 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
FXNQ16595 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
FXNQ16595 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
FXNQ16595 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
FXNQ16595 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
FXNQ16595 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
FXNQ16595 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
FXNQ16595 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
FXNQ16595 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
FXNQ16595 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
FXNQ16595 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
FXNQ16595 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
FXNQ16595 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
FXNQ16595 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.93
FXNQ16595 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
FXNQ16595 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
FXNQ16595 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
FXNQ16595 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
FXNQ16595 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
FXNQ16595 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
FXNQ16595 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
FXNQ16595 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
FXNQ16595 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
FXNQ16595 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
FXNQ16595 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
FXNQ16595 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
FXNQ16595 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
FXNQ16595 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
FXNQ16595 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
FXNQ16595 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
FXNQ16595 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
FXNQ16595 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
FXNQ16595 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
FXNQ16595 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
FXNQ16595 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
FXNQ16595 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
FXNQ16595 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
FXNQ16595 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
FXNQ16595 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
FXNQ16595 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
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FXNQ16595 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
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FXNQ16595 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
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FXNQ16595 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
FXNQ16595 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
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FXNQ16595 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
FXNQ16595 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
FXNQ16595 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
FXNQ16595 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
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FXNQ16595 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
FXNQ16595 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
FXNQ16595 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
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FXNQ16595 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
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FXNQ16595 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
FXNQ16595 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
FXNQ16595 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
FXNQ16595 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
FXNQ16595 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
FXNQ16595 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
FXNQ16595 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
FXNQ16595 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
FXNQ16595 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
FXNQ16595 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
FXNQ16595 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
FXNQ16595 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
FXNQ16595 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
FXNQ16595 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
FXNQ16595 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
FXNQ16595 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
FXNQ16595 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
FXNQ16595 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
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