Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC1.09□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
SGCAQ16586 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
SGCAQ16586 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SGCAQ16586 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SGCAQ16586 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SGCAQ16586 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SGCAQ16586 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
SGCAQ16586 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SGCAQ16586 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SGCAQ16586 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SGCAQ16586 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SGCAQ16586 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SGCAQ16586 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
SGCAQ16586 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SGCAQ16586 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
SGCAQ16586 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SGCAQ16586 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SGCAQ16586 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SGCAQ16586 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SGCAQ16586 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SGCAQ16586 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SGCAQ16586 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SGCAQ16586 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
SGCAQ16586 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SGCAQ16586 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SGCAQ16586 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
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SGCAQ16586 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SGCAQ16586 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
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SGCAQ16586 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SGCAQ16586 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
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SGCAQ16586 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
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SGCAQ16586 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SGCAQ16586 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
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SGCAQ16586 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
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SGCAQ16586 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
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SGCAQ16586 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
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SGCAQ16586 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SGCAQ16586 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
SGCAQ16586 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
SGCAQ16586 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
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SGCAQ16586 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SGCAQ16586 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC1.06□□□□□ -2.24
SGCAQ16586 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SGCAQ16586 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SGCAQ16586 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SGCAQ16586 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
SGCAQ16586 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SGCAQ16586 AC068137.4-201ENST00000638485 296 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SGCAQ16586 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SGCAQ16586 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SGCAQ16586 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SGCAQ16586 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SGCAQ16586 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
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