Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SLC18A3Q16572 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SLC18A3Q16572 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SLC18A3Q16572 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SLC18A3Q16572 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SLC18A3Q16572 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SLC18A3Q16572 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SLC18A3Q16572 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SLC18A3Q16572 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SLC18A3Q16572 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SLC18A3Q16572 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SLC18A3Q16572 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SLC18A3Q16572 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SLC18A3Q16572 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SLC18A3Q16572 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SLC18A3Q16572 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SLC18A3Q16572 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SLC18A3Q16572 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SLC18A3Q16572 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SLC18A3Q16572 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SLC18A3Q16572 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SLC18A3Q16572 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SLC18A3Q16572 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SLC18A3Q16572 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SLC18A3Q16572 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SLC18A3Q16572 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SLC18A3Q16572 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SLC18A3Q16572 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SLC18A3Q16572 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SLC18A3Q16572 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SLC18A3Q16572 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SLC18A3Q16572 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SLC18A3Q16572 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SLC18A3Q16572 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SLC18A3Q16572 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SLC18A3Q16572 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SLC18A3Q16572 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SLC18A3Q16572 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SLC18A3Q16572 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SLC18A3Q16572 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SLC18A3Q16572 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SLC18A3Q16572 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SLC18A3Q16572 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SLC18A3Q16572 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SLC18A3Q16572 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SLC18A3Q16572 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SLC18A3Q16572 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SLC18A3Q16572 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SLC18A3Q16572 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
SLC18A3Q16572 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SLC18A3Q16572 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
SLC18A3Q16572 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
SLC18A3Q16572 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SLC18A3Q16572 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SLC18A3Q16572 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SLC18A3Q16572 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SLC18A3Q16572 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SLC18A3Q16572 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SLC18A3Q16572 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SLC18A3Q16572 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SLC18A3Q16572 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SLC18A3Q16572 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SLC18A3Q16572 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SLC18A3Q16572 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SLC18A3Q16572 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SLC18A3Q16572 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SLC18A3Q16572 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SLC18A3Q16572 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
SLC18A3Q16572 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
SLC18A3Q16572 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SLC18A3Q16572 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SLC18A3Q16572 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SLC18A3Q16572 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SLC18A3Q16572 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SLC18A3Q16572 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SLC18A3Q16572 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SLC18A3Q16572 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SLC18A3Q16572 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SLC18A3Q16572 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SLC18A3Q16572 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SLC18A3Q16572 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SLC18A3Q16572 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SLC18A3Q16572 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SLC18A3Q16572 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
SLC18A3Q16572 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
SLC18A3Q16572 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SLC18A3Q16572 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SLC18A3Q16572 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SLC18A3Q16572 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SLC18A3Q16572 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SLC18A3Q16572 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SLC18A3Q16572 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SLC18A3Q16572 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SLC18A3Q16572 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SLC18A3Q16572 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SLC18A3Q16572 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SLC18A3Q16572 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SLC18A3Q16572 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SLC18A3Q16572 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SLC18A3Q16572 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
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