Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SCN9AQ15858 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SCN9AQ15858 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC0.44□□□□□ -2.34
SCN9AQ15858 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SCN9AQ15858 AC093424.1-201ENST00000604999 338 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SCN9AQ15858 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SCN9AQ15858 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SCN9AQ15858 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SCN9AQ15858 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SCN9AQ15858 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SCN9AQ15858 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SCN9AQ15858 CETN4P-201ENST00000432407 469 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SCN9AQ15858 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SCN9AQ15858 ZNF736P8Y-201ENST00000451913 669 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
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SCN9AQ15858 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SCN9AQ15858 AP001372.4-201ENST00000524889 472 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SCN9AQ15858 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SCN9AQ15858 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SCN9AQ15858 AL136370.1-201ENST00000608166 691 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SCN9AQ15858 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SCN9AQ15858 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SCN9AQ15858 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SCN9AQ15858 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SCN9AQ15858 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SCN9AQ15858 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SCN9AQ15858 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SCN9AQ15858 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
SCN9AQ15858 AL445567.1-201ENST00000439121 144 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SCN9AQ15858 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SCN9AQ15858 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC0.43□□□□□ -2.34
SCN9AQ15858 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SCN9AQ15858 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SCN9AQ15858 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SCN9AQ15858 AC022166.2-201ENST00000566030 536 ntTSL 4 BASIC0.43□□□□□ -2.34
SCN9AQ15858 AC008088.1-201ENST00000580993 280 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SCN9AQ15858 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SCN9AQ15858 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC0.43□□□□□ -2.34
SCN9AQ15858 AL050303.3-201ENST00000613704 284 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SCN9AQ15858 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SCN9AQ15858 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SCN9AQ15858 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC0.42□□□□□ -2.34
SCN9AQ15858 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SCN9AQ15858 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
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SCN9AQ15858 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
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SCN9AQ15858 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
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SCN9AQ15858 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SCN9AQ15858 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SCN9AQ15858 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SCN9AQ15858 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
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SCN9AQ15858 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
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SCN9AQ15858 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
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SCN9AQ15858 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
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SCN9AQ15858 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
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SCN9AQ15858 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SCN9AQ15858 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC0.41□□□□□ -2.34
SCN9AQ15858 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 AC063965.1-201ENST00000416679 499 ntTSL 3 BASIC0.4□□□□□ -2.35
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SCN9AQ15858 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC0.4□□□□□ -2.35
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SCN9AQ15858 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC0.4□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
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