Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
USF2Q15853 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC0.33□□□□□ -2.36
USF2Q15853 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
USF2Q15853 AC008568.1-203ENST00000433406 765 ntTSL 3 BASIC0.33□□□□□ -2.36
USF2Q15853 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
USF2Q15853 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
USF2Q15853 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
USF2Q15853 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC0.33□□□□□ -2.36
USF2Q15853 MTND1P22-201ENST00000510572 951 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
USF2Q15853 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
USF2Q15853 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
USF2Q15853 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC0.33□□□□□ -2.36
USF2Q15853 AHI1-212ENST00000528103 441 ntTSL 1 (best) BASIC0.33□□□□□ -2.36
USF2Q15853 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
USF2Q15853 AC079248.2-201ENST00000623779 326 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
USF2Q15853 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
USF2Q15853 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
USF2Q15853 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
USF2Q15853 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
USF2Q15853 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
USF2Q15853 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
USF2Q15853 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
USF2Q15853 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
USF2Q15853 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
USF2Q15853 LINC02462-201ENST00000503009 430 ntTSL 5 BASIC0.32□□□□□ -2.36
USF2Q15853 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
USF2Q15853 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
USF2Q15853 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC0.32□□□□□ -2.36
USF2Q15853 AL670729.3-201ENST00000602345 574 ntTSL 4 BASIC0.32□□□□□ -2.36
USF2Q15853 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
USF2Q15853 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
USF2Q15853 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
USF2Q15853 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC0.32□□□□□ -2.36
USF2Q15853 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
USF2Q15853 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
USF2Q15853 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
USF2Q15853 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
USF2Q15853 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
USF2Q15853 AC000123.1-201ENST00000418215 516 ntTSL 5 BASIC0.31□□□□□ -2.36
USF2Q15853 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
USF2Q15853 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
USF2Q15853 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC0.31□□□□□ -2.36
USF2Q15853 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
USF2Q15853 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
USF2Q15853 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
USF2Q15853 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
USF2Q15853 LINC02500-201ENST00000512547 493 ntTSL 3 BASIC0.31□□□□□ -2.36
USF2Q15853 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
USF2Q15853 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
USF2Q15853 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
USF2Q15853 AC009094.1-201ENST00000564443 426 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
USF2Q15853 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
USF2Q15853 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
USF2Q15853 AC245884.10-201ENST00000597355 337 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
USF2Q15853 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
USF2Q15853 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
USF2Q15853 AC122133.1-201ENST00000613964 233 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
USF2Q15853 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
USF2Q15853 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
USF2Q15853 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
USF2Q15853 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
USF2Q15853 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
USF2Q15853 AC099063.1-201ENST00000437128 324 ntTSL 5 BASIC0.3□□□□□ -2.36
USF2Q15853 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC0.3□□□□□ -2.36
USF2Q15853 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC0.3□□□□□ -2.36
USF2Q15853 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC0.3□□□□□ -2.36
USF2Q15853 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
USF2Q15853 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
USF2Q15853 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
USF2Q15853 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
USF2Q15853 AC060788.1-201ENST00000521318 469 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
USF2Q15853 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
USF2Q15853 MIR3913-1-201ENST00000577744 102 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
USF2Q15853 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
USF2Q15853 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC0.3□□□□□ -2.36
USF2Q15853 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
USF2Q15853 AC007494.3-201ENST00000624660 743 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
USF2Q15853 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
USF2Q15853 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
USF2Q15853 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
USF2Q15853 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
USF2Q15853 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
USF2Q15853 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
USF2Q15853 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
USF2Q15853 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
USF2Q15853 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
USF2Q15853 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
USF2Q15853 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
USF2Q15853 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
USF2Q15853 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC0.29□□□□□ -2.36
USF2Q15853 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC0.29□□□□□ -2.36
USF2Q15853 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
USF2Q15853 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
USF2Q15853 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC0.29□□□□□ -2.36
USF2Q15853 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC0.29□□□□□ -2.36
USF2Q15853 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
USF2Q15853 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
USF2Q15853 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
USF2Q15853 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
USF2Q15853 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
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