Protein–RNA interactions for Protein: Q15797

SMAD1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD1Q15797 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SMAD1Q15797 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SMAD1Q15797 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SMAD1Q15797 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SMAD1Q15797 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SMAD1Q15797 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SMAD1Q15797 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SMAD1Q15797 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SMAD1Q15797 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SMAD1Q15797 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SMAD1Q15797 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SMAD1Q15797 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SMAD1Q15797 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SMAD1Q15797 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SMAD1Q15797 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SMAD1Q15797 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SMAD1Q15797 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SMAD1Q15797 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SMAD1Q15797 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SMAD1Q15797 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SMAD1Q15797 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SMAD1Q15797 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SMAD1Q15797 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SMAD1Q15797 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SMAD1Q15797 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SMAD1Q15797 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SMAD1Q15797 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SMAD1Q15797 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SMAD1Q15797 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SMAD1Q15797 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SMAD1Q15797 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SMAD1Q15797 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SMAD1Q15797 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SMAD1Q15797 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SMAD1Q15797 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SMAD1Q15797 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SMAD1Q15797 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SMAD1Q15797 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SMAD1Q15797 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SMAD1Q15797 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SMAD1Q15797 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SMAD1Q15797 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SMAD1Q15797 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SMAD1Q15797 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SMAD1Q15797 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SMAD1Q15797 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SMAD1Q15797 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SMAD1Q15797 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SMAD1Q15797 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SMAD1Q15797 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SMAD1Q15797 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SMAD1Q15797 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SMAD1Q15797 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SMAD1Q15797 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SMAD1Q15797 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SMAD1Q15797 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SMAD1Q15797 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SMAD1Q15797 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
SMAD1Q15797 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SMAD1Q15797 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SMAD1Q15797 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SMAD1Q15797 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SMAD1Q15797 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SMAD1Q15797 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SMAD1Q15797 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SMAD1Q15797 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SMAD1Q15797 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SMAD1Q15797 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SMAD1Q15797 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SMAD1Q15797 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SMAD1Q15797 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SMAD1Q15797 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SMAD1Q15797 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SMAD1Q15797 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SMAD1Q15797 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SMAD1Q15797 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SMAD1Q15797 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SMAD1Q15797 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SMAD1Q15797 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SMAD1Q15797 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SMAD1Q15797 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SMAD1Q15797 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SMAD1Q15797 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SMAD1Q15797 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SMAD1Q15797 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SMAD1Q15797 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SMAD1Q15797 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SMAD1Q15797 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SMAD1Q15797 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SMAD1Q15797 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SMAD1Q15797 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SMAD1Q15797 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SMAD1Q15797 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SMAD1Q15797 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SMAD1Q15797 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SMAD1Q15797 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SMAD1Q15797 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SMAD1Q15797 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SMAD1Q15797 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
SMAD1Q15797 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.2 ms